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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001791`

染色体: Chr02 坐标: 32662522-32665109 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001791`
名称	SmilChr02G001791
描述	transcription factor TCP4-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	32662522 - 32665109 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012040`
GeneID	`131012040`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012040`
原始查询	`SmilChr02G001791`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor TCP4-like
产物	transcription factor TCP4-like
Arabidopsis	`AT3G15030` (TCP4) TCP family transcription factor 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820732] identity=48.8; qcov=1.18; evalue=9.61e-96; confidence=high
Rice	`Os01g0213800` (OsPCF5) - identity=47.8; qcov=1.05; evalue=3.32e-83; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:2000032 (regulation of secondary shoot formation)
KEGG	-
Pfam	PF03634 (TCP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012040

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795933.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795933.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795933.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795933.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795933.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:32662996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B91
`Chr2:32663148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr2:32663215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C2,D7
`Chr2:32663232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:32663247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B20
`Chr2:32663247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr2:32663554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C2,D7
`Chr2:32663638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:32663650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:32663668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,D11
`Chr2:32663719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,C36,C8
`Chr2:32663821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795933.1

341 aa

170

341

TCP

PF03634 TCP 32-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795933.1`	Pfam	`PF03634`	TCP	Family	32	114	3.6e-31	109.5	TCP family transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939950.1
GACAAAGCGGCATGTAATTAATAAATTGAAATTTACAAACTGGGAGTCAATACTTTTTTTTCCCCCTTTGATATTATCTTTTTTCTTGATCAATTATAGAAAGGGAAAAAGGAAAAAGTGAGATGAAATTAAAGAGGGATGCCAATATGCCATGTAGAGATAATTCAACACACCAGAAAAAGTAGTTTGGGAGAAAGATATTTGAGGGAAAATTTGTGTTGTTTCTTTTAAGTGAAGCAAGAGAGAGAAAGAAGAGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012040
ATGGGGGAGAGCAGCCAGCAGCAGAGAATAGGGGCGAGGGCCACCGTGGGGGAGGTGGTGGAGGTGCAAGGCGGCCACATTGTCCGCGCCACCGGCCGGAAAGACCGCCACAGCAAAGTGTGCACCGCCAAGGGCCCCAGAGACCGGCGCGTCCGCCTCGCCGCCCACACCGCCATCCAATTCTACGACGTCCAAGACCGCCTCGGCTACGACCGCCCCAGCAAGGCCGTCGATTGGCTCATCAAGAAGGCCAAATCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795933.1
MGESSQQQRIGARATVGEVVEVQGGHIVRATGRKDRHSKVCTAKGPRDRRVRLAAHTAIQFYDVQDRLGYDRPSKAVDWLIKKAKSSIDELDHLPAWHPTATTPSSAAQDTPASSTKPMPAQNPNSQISSFLPPSLDSDVIADTIKSFFPVAGEASSSAMQFHSFTSSDMISRSSSHTQDLRLSLQSLQDPILHAQAAAPPRQVLLSGTPLGFDGGWLDHHQQAAELSRLQRFADAPAGYFFNPPPPPPPPPLLQQLLGH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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