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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001804`

染色体: Chr02 坐标: 32888362-32892208 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001804`
名称	SmilChr02G001804
描述	UBP1-associated protein 2C
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	32888362 - 32892208 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012056`
GeneID	`131012056`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012056`
原始查询	`SmilChr02G001804`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UBP1-associated protein 2C
产物	UBP1-associated protein 2C
Arabidopsis	`AT3G15010` (AT3G15010) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820730] identity=57.9; qcov=0.667; evalue=1.25e-111; confidence=high
Rice	`Os01g0265800` (RBP-P) - identity=48.5; qcov=0.504; evalue=1.62e-65; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012056

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795940.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057795940.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057795940.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795940.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795940.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:32890611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C26,C74
`Chr2:32890611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C74
`Chr2:32890617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr2:32890735`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B81
`Chr2:32890735`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B81
`Chr2:32890839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:32890976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B43,C30
`Chr2:32890979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr2:32891163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:32891173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr2:32891179`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B97
`Chr2:32891179`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795940.1

466 aa

233

466

RRM_1

PF00076 RRM_1 72-138 aa PF00076 RRM_1 178-234 aa

XP_057795942.1

466 aa

233

466

RRM_1

PF00076 RRM_1 72-138 aa PF00076 RRM_1 178-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795940.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	72	138	7.2e-27	93.8	RNA recognition motif
`XP_057795940.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	178	234	7.2e-27	93.8	RNA recognition motif
`XP_057795942.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	72	138	7.2e-27	93.8	RNA recognition motif
`XP_057795942.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	178	234	7.2e-27	93.8	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939959.1
TATTCATATTCAAAGTTAGTGAACCGACTCAAATAATACAGATGGAATGGAAGGGCGGGTAAGCGGGCTTCCGGATAAAAAGGGGCCCCCAATATCCGGTGGGGCCCACGGAGATGGAAACTGTAAATTGTCGAGCAACTTTATTGTACTTGCACTCAGCTAAGCTCAAACTTTCCCAAAATTAGGGTTTTACACTCTTCATATCTTCACCTTCCCTACAATGGACCCAACCAAGAAGCGCAAAATGGAAGAAACCGGCG...

XM_057939957.1
TATTCATATTCAAAGTTAGTGAACCGACTCAAATAATACAGATGGAATGGAAGGGCGGGTAAGCGGGCTTCCGGATAAAAAGGGGCCCCCAATATCCGGTGGGGCCCACGGAGATGGAAACTGTAAATTGTCGAGCAACTTTATTGTACTTGCACTCAGCTAAGCTCAAACTTTCCCAAAATTAGGGTTTTACACTCTTCATATCTTCACCTTCCCTACAATGGACCCAACCAAGAAGCGCAAAATGGAAGAAACCGGCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012056
ATGGACCCAACCAAGAAGCGCAAAATGGAAGAAACCGGCGCCGACCCCGACGCCTTCAACCCCCTCATGCTCACCGTCGACGACGCCCGCCGCATTCTCGACTCGCTCACCCACGACCAGCTGCTGGAAATTGTCCAAAACGCCCTCCTCCGCCACCCCGACGTCCTCGACGCCGTCCGATCGCTCGCTGACCGCGACACCGCGCAGAGGAAGCTCTTCATCCGCGGCTTGGGCTGGGAAACCACCACGGAGAAGCTCCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795940.1
MDPTKKRKMEETGADPDAFNPLMLTVDDARRILDSLTHDQLLEIVQNALLRHPDVLDAVRSLADRDTAQRKLFIRGLGWETTTEKLRALFSSYGELDEAVVILDKVTGKSKGYGFITFKHIDGAIMALKDPSKKIDGRMTVTQLAAAGISGGGGPAAGGGGGGGGGVNNPVDVSMRKIYVSNVPYDMAAERLLQHFSMYGEIEEGPLGFDKATGKSKGFALFVYKTAEAARASLVDPVKSIDGHQLNCKLAIDGKRGKPP...

XP_057795942.1
MDPTKKRKMEETGADPDAFNPLMLTVDDARRILDSLTHDQLLEIVQNALLRHPDVLDAVRSLADRDTAQRKLFIRGLGWETTTEKLRALFSSYGELDEAVVILDKVTGKSKGYGFITFKHIDGAIMALKDPSKKIDGRMTVTQLAAAGISGGGGPAAGGGGGGGGGVNNPVDVSMRKIYVSNVPYDMAAERLLQHFSMYGEIEEGPLGFDKATGKSKGFALFVYKTAEAARASLVDPVKSIDGHQLNCKLAIDGKRGKPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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