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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001807`

染色体: Chr02 坐标: 32905498-32908372 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001807`
名称	SmilChr02G001807
描述	multiple organellar RNA editing factor 8, chloroplastic/mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	32905498 - 32908372 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012059`
GeneID	`131012059`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012059`
原始查询	`SmilChr02G001807`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	multiple organellar RNA editing factor 8, chloroplastic/mitochondrial
产物	multiple organellar RNA editing factor 8%2C chloroplastic/mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G15000` (RIP1) cobalt ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820729] identity=62.5; qcov=0.82; evalue=7.17e-101; confidence=high
Rice	`Os09g0132600` - identity=71.6; qcov=0.541; evalue=1.74e-106; confidence=medium
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0016554 (cytidine to uridine editing); GO:0080156 (mitochondrial mRNA modification)
KEGG	-
Pfam	PF21864 (MORF_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012059

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057795945.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057795945.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795945.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795945.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795945.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:32905791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr2:32905829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B91
`Chr2:32906016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:32906063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:32906200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:32906227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:32908022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C57,C82
`Chr2:32908028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr2:32908120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795945.1

416 aa

208

416

MORF_dom

PF21864 MORF_dom 102-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795945.1`	Pfam	`PF21864`	MORF_dom	Domain	102	193	4.7e-39	132.9	Multiple organellar RNA editing factor 1, MORF domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939962.1
TAACTGATTTGGCAATATTTAGAAAATTCAGGGGCCTTTTGATAAGTTGTGTGTATTTATACCCCACGAGCCAAAACCCTCCATTCTAGTCGGCTCCCACTCTATCGCTAGGGTTTATCGACTGCGAAACCCTCACTCCGCGAAAATGGCGACGCGATTTCTCGCCCGCTCCCTGCTCACCACCAAGCCGCCTCTCTCATCGGCCTTCTTTCACTCCTGCGGCGCTGCTTCTGCCACGTCATCCGCCGTTCTGCCGAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012059
ATGGCGACGCGATTTCTCGCCCGCTCCCTGCTCACCACCAAGCCGCCTCTCTCATCGGCCTTCTTTCACTCCTGCGGCGCTGCTTCTGCCACGTCATCCGCCGTTCTGCCGAATTCCTCATCATTTCTATTCCGCCTCCGCCCCATCGTGGCCGCGGCTTCCGCTTCCTATTTCCGCCGCCTGCTTCCGGCGATTTCCACCAGGGCGTTCTCGACTCGGCAGACTGAGTCGTCTCTGAATGATCCGAACCCTAACTGGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795945.1
MATRFLARSLLTTKPPLSSAFFHSCGAASATSSAVLPNSSSFLFRLRPIVAAASASYFRRLLPAISTRAFSTRQTESSLNDPNPNWSNRPPKETILLDGCDFEHWLVVVEKPEGDPTRDEIIDSYIKTLATVVGSEQEARMKIYSVSTRHYYAFGALVSEELSYKLKELPMVRWVLPDSYLDVKNKDYGGEPFINGQAVPYDPKYHEEWVRNNARANERNRRNDRPRNFDRSRNFERRREVQGQNAGGSPGGPGGNYGGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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