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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001808`

染色体: Chr02 坐标: 32910261-32912132 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001808`
名称	SmilChr02G001808
描述	NDR1/HIN1-like protein 10
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	32910261 - 32912132 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008323`
GeneID	`131008323`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008323`
原始查询	`SmilChr02G001808`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NDR1/HIN1-like protein 10
产物	NDR1/HIN1-like protein 10
Arabidopsis	`AT2G27260` (AT2G27260) Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817268] identity=37.3; qcov=0.716; evalue=1.32e-36; confidence=medium
Rice	`Os07g0531500` (P0681F05.132) - identity=29.5; qcov=0.582; evalue=7.7e-19; confidence=low
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03168 (LEA_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008323

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057791191.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791191.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791191.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791191.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791191.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:32910266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A4,B124,B125,B19,B81,B87,C71,C87
`Chr2:32910267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C4,C64
`Chr2:32910273`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	40	A20,A6,A8,B108,B121,B123,B136,B15,B18,B19,B25,B26,B3,B31,B35,B36,B37,B47,B51,B52,B54,B62,B63,B69,B77,B86,B9,C23,C26,C28,C3,C35,C39,C41,C74,C75,C79,C80,C82,C87
`Chr2:32910284`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B139,B42,B43,B64,B74,B76,C18,C50,C55
`Chr2:32910285`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B139,B42,B43,B64,B74,B76,C18,C50,C55
`Chr2:32910300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C4,C64
`Chr2:32910304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr2:32910338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,D1
`Chr2:32910370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B93
`Chr2:32910372`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	A1,A4,B115,B124,B24,B4,B49,B51,B86,C17,C26,C34,C41,C87,D9
`Chr2:32910413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B72,C40,C8
`Chr2:32910415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,C14,C16,C7,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791191.1

285 aa

142

285

LEA_2

PF03168 LEA_2 85-181 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791191.1`	Pfam	`PF03168`	LEA_2	Domain	85	181	1.6e-07	32.4	Late embryogenesis abundant protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935208.1
ATGTGTCATAGATTGGGCTTTATCCCCAACCAACAGCAGAACTACCAATACGACGCCGAGTCCGTCCGCCGCGCCACCTGCCTCCGCCGCATCTTCGCTTTTGTGATCGGCCTCATCGTCATCTTCGGCACAGTCACCTTCATCGTCTGGCTCATCCTCCGCCCCCAGCTTCCCGAGTTTCGAGTCGACTCCTTGTCTATCTCCATTTTCACGCTTGACAACGACTTGCTCATCTCCTTCACCTCCGAGATCAAGCTGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008323
ATGTGTCATAGATTGGGCTTTATCCCCAACCAACAGCAGAACTACCAATACGACGCCGAGTCCGTCCGCCGCGCCACCTGCCTCCGCCGCATCTTCGCTTTTGTGATCGGCCTCATCGTCATCTTCGGCACAGTCACCTTCATCGTCTGGCTCATCCTCCGCCCCCAGCTTCCCGAGTTTCGAGTCGACTCCTTGTCTATCTCCATTTTCACGCTTGACAACGACTTGCTCATCTCCTTCACCTCCGAGATCAAGCTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791191.1
MCHRLGFIPNQQQNYQYDAESVRRATCLRRIFAFVIGLIVIFGTVTFIVWLILRPQLPEFRVDSLSISIFTLDNDLLISFTSEIKLTAKNPNKKMKLGYDHIETAIYYQSYSLSETTVAPFYQGTKNETSLTARFAAAGSFLEKVAVDEITGERGKNDNVNFNLRMLSRVRFEAKVWMTRRRFLKVFCGDLVLGLPTSGRSGVLTGEPRQCRVGAFPLSLNHQNRFPSPFSPLSSLISLCFSPLSLSLSAIAHFSDENCQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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