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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001810`

染色体: Chr02 坐标: 32919823-32920953 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001810`
名称	SmilChr02G001810
描述	uncharacterized SmilChr02G001810
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	32919823 - 32920953 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008324`
GeneID	`131008324`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008324`
原始查询	`SmilChr02G001810`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=26.4; qcov=0.947; evalue=4.63e-38; confidence=low
Rice	`Os10g0104700` - identity=29.3; qcov=0.816; evalue=2.49e-35; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008324

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791192.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791192.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791192.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791192.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791192.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:32919829`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	56	A10,A14,A18,A21,A25,A9,B10,B102,B107,B111,B113,B114,B118,B119,B12,B120,B123,B128,B13,B132,B133,B134,B139,B16,B27,B28,B34,B4,B50,B52,B61,B64,B70,B72,B73,B75,B78,B80,B81,C17,C18,C21,C29,C34,C38,C43,C47,C53,C56,C57,C61,C63,C79,C81,D6,D8
`Chr2:32919835`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B139
`Chr2:32919835`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B139
`Chr2:32919925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B29,B60
`Chr2:32919989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr2:32919995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B128,B15,B98
`Chr2:32920005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B128,B15,B98
`Chr2:32920041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr2:32920064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29
`Chr2:32920104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:32920134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:32920178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791192.1

376 aa

188

376

MULE

Transposase_mut

PF10551 MULE 248-341 aa PF00872 Transposase_mut 263-369 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791192.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	248	341	1.3e-20	74.3	MULE transposase domain
`XP_057791192.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	263	369	6.3e-11	42.5	Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935209.1
ATGGCGATGATAATGCAAACAAACCCACGAGGTCTGTCTGAAGATTTAGGCCCAGAAGCGTCGCAGGAGCTGAGGAATTGGTTAGTTCCGGTTATTCCAGAAGATTTTACAGAGAATCTTTTTGCTGGTAGACTTGCTGACGTACCAAATCCCGACGAACTAACTGAAGGTTCGATATTCGAAAGCAAAGAACTTCTCAAGCTAGCTGTTGGCTTGTGGCATTTGGAACATCGAGCAGAATTCATCATTCCTCGTTCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008324
ATGGCGATGATAATGCAAACAAACCCACGAGGTCTGTCTGAAGATTTAGGCCCAGAAGCGTCGCAGGAGCTGAGGAATTGGTTAGTTCCGGTTATTCCAGAAGATTTTACAGAGAATCTTTTTGCTGGTAGACTTGCTGACGTACCAAATCCCGACGAACTAACTGAAGGTTCGATATTCGAAAGCAAAGAACTTCTCAAGCTAGCTGTTGGCTTGTGGCATTTGGAACATCGAGCAGAATTCATCATTCCTCGTTCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791192.1
MAMIMQTNPRGLSEDLGPEASQELRNWLVPVIPEDFTENLFAGRLADVPNPDELTEGSIFESKELLKLAVGLWHLEHRAEFIIPRSNLDRITFKCKYQNRCPFQLRATQQRSFWFIRKFGPAHTCIGDMVNTGVRKFHARVIAAHIAKKMHEDGEIVKPRTIMTDLQREYGVNISYSVTIRARNGAVEMIYGGHKESYSLLPAYLHMLRTCNPGSLTDLEIDASGRFKHLFVALGSCRLAYTMCLRTVIVVDGTHLKGSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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