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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001825`

染色体: Chr02 坐标: 33281548-33283289 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001825`
名称	SmilChr02G001825
描述	peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase A-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	33281548 - 33283289 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008326`
GeneID	`131008326`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008326`
原始查询	`SmilChr02G001825`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase A-like
产物	peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase A-like
Arabidopsis	`AT3G14920` (AT3G14920) Peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase A protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820721] identity=52.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0207200` - identity=50.9; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005773 (vacuole)
KEGG	-
Pfam	PF12222 (PNGaseA); PF25156 (PNGase_A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008326

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057791193.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057791193.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057791193.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791193.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791193.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:33281905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C8
`Chr2:33281915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr2:33281952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B54,B9,C17,C69
`Chr2:33282009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,B74
`Chr2:33282019`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B24,B72
`Chr2:33282019`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B24,B72
`Chr2:33282026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:33282090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B54,B9,C69
`Chr2:33282117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B35,B55,B56,B96
`Chr2:33282475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C41
`Chr2:33282477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:33282498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791193.1

559 aa

280

559

PNGaseA

PNGase_A_C

PF12222 PNGaseA 52-362 aa PF25156 PNGase_A_C 381-440 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791193.1`	Pfam	`PF12222`	PNGaseA	Domain	52	362	1.1e-102	344.0	Peptide N-acetyl-beta-D-glucosaminyl asparaginase amidase A
`XP_057791193.1`	Pfam	`PF25156`	PNGase_A_C	Domain	381	440	6.7e-10	39.6	PNGase_A C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935210.1
ATGGCACCTTCCCTAATTATCCCCTTCCTCCTCCTCTTGACTCTCACACTCCTCCAACCGCCACGCTCCGCCGCAAAGCTCCACAAGACCGCCCCCACCACCACCACTTACTTCGAAGTCACAAGGCCAATCCCTCTCCCCAAAACTCAACCCTGCTCTCACTCCATCCTCCATCATCAAGAATTCGCATACACCTACGCCAAACCACCCATCATCGCTACCTACTCACCACCACCCTCAAAATGCCAAAACTTCGACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008326
ATGGCACCTTCCCTAATTATCCCCTTCCTCCTCCTCTTGACTCTCACACTCCTCCAACCGCCACGCTCCGCCGCAAAGCTCCACAAGACCGCCCCCACCACCACCACTTACTTCGAAGTCACAAGGCCAATCCCTCTCCCCAAAACTCAACCCTGCTCTCACTCCATCCTCCATCATCAAGAATTCGCATACACCTACGCCAAACCACCCATCATCGCTACCTACTCACCACCACCCTCAAAATGCCAAAACTTCGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791193.1
MAPSLIIPFLLLLTLTLLQPPRSAAKLHKTAPTTTTYFEVTRPIPLPKTQPCSHSILHHQEFAYTYAKPPIIATYSPPPSKCQNFDKAVLEWTATCRGRQFDRIFGVWLGGVELLRSCTAEPTPSGIVWTVKKDVTRYRSLLLKEQNVSIYMGNIVDATYTGVYHVNLTFHFYPALGNHAAASPADFILPISRTPPFNGGAWFEIDNSTTTQGRELQIPNNAYRAVMEVYVSFHENDEFWYGNFPNEYISFNNLTDVAGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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