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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001834`

染色体: Chr02 坐标: 33408305-33413757 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001834`
名称	SmilChr02G001834
描述	protein GRAVITROPIC IN THE LIGHT 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	33408305 - 33413757 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012084`
GeneID	`131012084`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012084`
原始查询	`SmilChr02G001834`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein GRAVITROPIC IN THE LIGHT 1-like
产物	protein GRAVITROPIC IN THE LIGHT 1-like
Arabidopsis	`AT1G53380` (AT1G53380) - identity=52.3; qcov=1.04; evalue=4.05e-158; confidence=high
Rice	`Os01g0203800` - identity=44.8; qcov=0.904; evalue=4.82e-88; confidence=medium
GO	GO:0009639 (response to red or far red light); GO:0009959 (negative gravitropism)
KEGG	-
Pfam	PF04859 (DUF641); PF24994 (GIL1_IRKI_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012084

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057795978.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057795978.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057795978.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795978.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795978.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:33408896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B54,B9,C11,C69
`Chr2:33409248`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C62
`Chr2:33409248`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C62
`Chr2:33409249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B43
`Chr2:33409292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B43
`Chr2:33409388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B26,C30
`Chr2:33409412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B126,B65,C17
`Chr2:33409438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B72,C53
`Chr2:33409463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B120,B127,B67,C67
`Chr2:33409589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B8
`Chr2:33409631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B54,B9,C11,C69
`Chr2:33409744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795978.1

437 aa

218

437

DUF641

GIL1_IRKI_C

PF04859 DUF641 59-183 aa PF24994 GIL1_IRKI_C 385-435 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795978.1`	Pfam	`PF04859`	DUF641	Family	59	183	4.4e-42	144.1	Plant protein of unknown function (DUF641)
`XP_057795978.1`	Pfam	`PF24994`	GIL1_IRKI_C	Domain	385	435	1.3e-19	70.6	GIL1/IRKI C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939995.1
GATTACAAGTTTTGAGAGGGATAGAATTGTCCTAAACGTCAAAGCATTTTTTTTTTAACTTCTTAATTTTCTCTCTGTTATCTGGTCATCTTCGTTTTCTCCCGTCTCTCCAAAAAACCTCTCGCTCTCTCTCTGTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTTCCAATCCGACCGATTTTCGAGCTGCAAAACCCGACGAAAAAAATACGGATTTATAAAGTAACTGACGTTGTCTTTGTAAATTCCGGTGCTCCGATTCAGGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012084
ATGGATTCCGTCACGCACTCTGCAGTAACGCCCAAGAAGAGCCGCCTCGCCCGCACCTTCGCCAAGGTCCTGCACGCGCGCGCCGCCGCCGGAGTCGATGAAGATATCAGAAAGGCCAAATCTCGCGAGAAGATGAAGAAGGATCGCTTCAAAATTGACGAGGAGATGCGAGATAAGGCGGTTAGAGAAGCGTTTGTGGCGAAGCTCTTCGCCGGTTTATCTTCGATTAAGGCGTCGTATGCTCAGCTGCAGTACGCGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795978.1
MDSVTHSAVTPKKSRLARTFAKVLHARAAAGVDEDIRKAKSREKMKKDRFKIDEEMRDKAVREAFVAKLFAGLSSIKASYAQLQYAQSPYDADGIQSADQVIVAELKKLSELKQCYLKKELHESSPAKALLVAEAQEQSSLVKTYEITSKKLDSQVKLKESEIMFLKEKLVEINGDCKLLDKRLNSSGVQLAFPDGAELSRLRPSHFVALLRQVVKSVRSFVRLLVDEMESEDWDLDAAAASIQPGVSFWERTHICFAFE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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