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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001835`

染色体: Chr02 坐标: 33436143-33439547 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001835`
名称	SmilChr02G001835
描述	uncharacterized SmilChr02G001835
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	33436143 - 33439547 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012085`
GeneID	`131012085`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012085`
原始查询	`SmilChr02G001835`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833333]; symbol=AT5G33406; hit=AT5G33406; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833333]; symbol=AT5G33406; hit=AT5G33406; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G33406` (AT5G33406) hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833333] identity=40.8; qcov=1.02; evalue=1.88e-64; confidence=medium
Rice	`Os09g0499600` - identity=45.5; qcov=0.607; evalue=3.9e-41; confidence=medium
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012085

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795979.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795979.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795979.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795979.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795979.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:33436373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr2:33436385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B136,B39,B87
`Chr2:33436405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr2:33436466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,B98,C73
`Chr2:33436478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B132,B42
`Chr2:33436487`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	32	A11,A13,A16,B1,B100,B11,B117,B138,B139,B14,B2,B23,B28,B29,B37,B40,B43,B47,B50,B62,B76,B83,B95,C14,C21,C32,C4,C50,C61,C68,C75,D3
`Chr2:33436558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B40,B53,C41
`Chr2:33436654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr2:33436658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,A22,B18
`Chr2:33436752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A3,B119,C4,C58,C82
`Chr2:33436752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B119,C4,C58,C82
`Chr2:33436766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A2,A20,B106,B120,B124,B129,B139,B87,C7,C72,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795979.1

275 aa

138

275

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 45-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795979.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	45	115	8.3e-14	51.9	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939996.1
GGCGGCCATGGCGGGATATGGCGGAAATTTGGCCCATACCCGCTTTACAGGCGGGTCGACCCGTTGACCCGACCCTTTGACCCTTTGACTTAGTTATATTAGGTTTAAAAATTAGGGTTTCAACATTGTAGTAGCCTCCAATGTTCAAACTTCAAACTTGAAACTACTCAGCGGCGCCTCCTCTGATTCTCGGACCGGCGACCACTGCTCCGGCGACGCACCGGCGACCCACTGCTCCGGCGAGCTCCGGCGATCTCCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012085
ATGGAGGTCACTAGAGGATTGTATGATACCATTGAAAGGTTGGTGCCAAGCAAAGATGTTCAAGACAAGATTCTTGTAGAGATGGCAAGCTACAAGTCTCGTGGTGGTCTATTTGGTAGTGACTTCGCTGAACGACAACGCAAGAAAATTCCTCCCGCTCAATGGTGGAGGATGTATGGCCACTCGGCTCCAAATTTGCAACAACTTGCTATTAAAATCTTAGGCCTAACTTGTAGTGCATCCGGATGTGAGCGCAATTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795979.1
MEVTRGLYDTIERLVPSKDVQDKILVEMASYKSRGGLFGSDFAERQRKKIPPAQWWRMYGHSAPNLQQLAIKILGLTCSASGCERNWSVFEQIHSKKRNRLEHKKLHDLVYVKYNQKLVERFNHRHEIDPISLNDIDQCNEWLVGEVDDENDEGDDLVFEGDSLNWDTVYEASGAGELATYTRRATTGKRKQSSSGVGASSRATSVRSKKNTMTSTSSRSKGKGLERVLELEDEELDDEDETDDIDEESEGEEEEGFAPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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