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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001836`

染色体: Chr02 坐标: 33437364-33438937 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001836`
名称	SmilChr02G001836
描述	uncharacterized SmilChr02G001836
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	33437364 - 33438937 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008327`
GeneID	`131008327`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008327`
原始查询	`SmilChr02G001836`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0537000; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os12g0537000; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G17450` (AT3G17450) hAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821009] identity=34; qcov=1.02; evalue=1.15e-92; confidence=low
Rice	`Os12g0537000` - identity=37.9; qcov=1.02; evalue=2.26e-111; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659); PF26664 (zf-BED_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008327

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791194.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791194.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791194.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791194.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791194.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:33437371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B131,B24
`Chr2:33437447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,C34,C63,C67
`Chr2:33437488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A3,B119,B53,B7,C4,C58,C82
`Chr2:33437498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:33437503`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A2,B72
`Chr2:33437503`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A2,B72
`Chr2:33437557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:33437566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr2:33437611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr2:33437659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr2:33437675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B3,C27,D11
`Chr2:33437697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B131,B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791194.1

510 aa

255

510

zf-BED_2

DUF659

PF26664 zf-BED_2 31-77 aa PF04937 DUF659 200-347 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791194.1`	Pfam	`PF26664`	zf-BED_2	Domain	31	77	5.9e-11	42.7	BED-like zinc finger
`XP_057791194.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	200	347	1.1e-59	201.1	Domain of unknown function (DUF659)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935211.1
ATGTCGGCGTCGGGTGAAGCTTCTTCAGCCCCTAATACTGTTGTTAAGAGTAATGACCCGGGTTGGAAGCACTGTGTGGCTGTCGGACCGGGCACGAACAAAGTAAAGTGCCTATATTGCGGCAAGGTTATGAATTTCGGCATCACTAGAGGGAAGGAGCACTTAATTGGAAAGAGGGGCAAGGTGGCACCGTGTAAGCAAGCCCCACCAAGTGTTCGAACGGAGTTGTTGGAGTATTATCAAGCTAAAGAGAATGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008327
ATGTCGGCGTCGGGTGAAGCTTCTTCAGCCCCTAATACTGTTGTTAAGAGTAATGACCCGGGTTGGAAGCACTGTGTGGCTGTCGGACCGGGCACGAACAAAGTAAAGTGCCTATATTGCGGCAAGGTTATGAATTTCGGCATCACTAGAGGGAAGGAGCACTTAATTGGAAAGAGGGGCAAGGTGGCACCGTGTAAGCAAGCCCCACCAAGTGTTCGAACGGAGTTGTTGGAGTATTATCAAGCTAAAGAGAATGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791194.1
MSASGEASSAPNTVVKSNDPGWKHCVAVGPGTNKVKCLYCGKVMNFGITRGKEHLIGKRGKVAPCKQAPPSVRTELLEYYQAKENEKKGTNPKDIDLGFGFDDEEDESATQTPSARSCGTSQPIKKGSIEMFLTKTTSSKDKGKQTNIRGAIDKEAVARVHQYIARFWYQAGLSFNLVKLDAFQNMIEAIGAFGRNLPAPSYHSIRVPLLNKELEYTNNLLEKNKEEWGRHGCSIMSDGWTDRKQRTIINFSVNSPSGTV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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