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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001838`

染色体: Chr02 坐标: 33501993-33508380 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001838`
名称	SmilChr02G001838
描述	gamma-glutamyl hydrolase 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	33501993 - 33508380 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012086`
GeneID	`131012086`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012086`
原始查询	`SmilChr02G001838`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	gamma-glutamyl hydrolase 2-like
产物	gamma-glutamyl hydrolase 2-like
Arabidopsis	`AT1G78680` (GGH2) gamma-glutamyl hydrolase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844204] identity=58.9; qcov=0.902; evalue=9.81e-113; confidence=high
Rice	`Os05g0517500` - identity=66.4; qcov=0.721; evalue=4.99e-98; confidence=high
GO	GO:0005773 (vacuole); GO:0034722 (gamma-glutamyl-peptidase activity); GO:0046900 (tetrahydrofolylpolyglutamate metabolic process)
KEGG	smil00790 (Folate biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00117 (GATase); PF07722 (Peptidase_C26)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012086

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057795982.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057795980.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057795986.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795982.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795982.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:33502360`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	155	A1,A13,A14,A15,A16,A18,A20,A21,A22,A23,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B104,B106,B107,B108,B110,B111,B113,B114,B115,B119,B121,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B130,B131,B134,B135,B136,B137,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B28,B3,B30,B31,B33,B34,B36,B4,B40,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B57,B58,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B7,B70,B71,B72,B73,B75,B77,B79,B80,B81,B83,B84,B86,B87,B88,B9,B96,B98,B99,C1,C10,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C35,C36,C37,C39,C4,C41,C43,C44,C46,C47,C48,C5,C53,C59,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C67,C70,C72,C75,C76,C78,C8,C80,C84,C87,D1,D2,D3,D5,D7,D8
`Chr2:33503452`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	79	A1,A13,A14,A18,A19,A3,A9,B102,B103,B106,B11,B112,B113,B114,B120,B129,B132,B133,B138,B14,B140,B16,B17,B22,B26,B27,B34,B35,B37,B4,B51,B52,B53,B55,B57,B59,B70,B75,B84,B85,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B98,C1,C12,C2,C22,C27,C32,C34,C38,C40,C42,C45,C46,C5,C55,C56,C57,C58,C59,C63,C64,C66,C68,C7,C71,C77,C83,C86,D1,D10,D6,D9
`Chr2:33503456`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C51
`Chr2:33503456`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C51
`Chr2:33503458`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C51
`Chr2:33503458`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C51
`Chr2:33503530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B29,B97,C52
`Chr2:33505396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:33508013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr2:33508015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,A9,B140,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795980.1

389 aa

194

389

Peptidase_C26

GATase

PF07722 Peptidase_C26 87-304 aa PF00117 GATase 122-310 aa

XP_057795981.1

388 aa

194

388

Peptidase_C26

GATase

PF07722 Peptidase_C26 87-303 aa PF00117 GATase 122-309 aa

XP_057795982.1

382 aa

191

382

Peptidase_C26

GATase

PF07722 Peptidase_C26 87-304 aa PF00117 GATase 122-310 aa

XP_057795983.1

381 aa

190

381

Peptidase_C26

GATase

PF07722 Peptidase_C26 87-303 aa PF00117 GATase 122-309 aa

XP_057795984.1

358 aa

179

358

Peptidase_C26

GATase

PF07722 Peptidase_C26 87-194 aa PF00117 GATase 122-279 aa

XP_057795985.1

334 aa

167

334

Peptidase_C26

GATase

PF07722 Peptidase_C26 87-304 aa PF00117 GATase 122-308 aa

XP_057795986.1

305 aa

152

305

Peptidase_C26

GATase

PF07722 Peptidase_C26 87-304 aa PF00117 GATase 122-305 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795980.1`	Pfam	`PF07722`	Peptidase_C26	Domain	87	304	1.9e-13	51.5	Peptidase C26
`XP_057795980.1`	Pfam	`PF00117`	GATase	Domain	122	310	2e-10	41.4	Glutamine amidotransferase class-I
`XP_057795981.1`	Pfam	`PF07722`	Peptidase_C26	Domain	87	303	1.1e-13	52.3	Peptidase C26
`XP_057795981.1`	Pfam	`PF00117`	GATase	Domain	122	309	4.9e-12	46.6	Glutamine amidotransferase class-I
`XP_057795982.1`	Pfam	`PF07722`	Peptidase_C26	Domain	87	304	1.8e-13	51.5	Peptidase C26
`XP_057795982.1`	Pfam	`PF00117`	GATase	Domain	122	310	1.9e-10	41.5	Glutamine amidotransferase class-I
`XP_057795983.1`	Pfam	`PF07722`	Peptidase_C26	Domain	87	303	9.9e-14	52.4	Peptidase C26
`XP_057795983.1`	Pfam	`PF00117`	GATase	Domain	122	309	4.7e-12	46.7	Glutamine amidotransferase class-I
`XP_057795984.1`	Pfam	`PF07722`	Peptidase_C26	Domain	87	194	2.2e-10	41.4	Peptidase C26
`XP_057795984.1`	Pfam	`PF00117`	GATase	Domain	122	279	6.8e-08	33.1	Glutamine amidotransferase class-I
`XP_057795985.1`	Pfam	`PF07722`	Peptidase_C26	Domain	87	304	1.1e-13	52.3	Peptidase C26
`XP_057795985.1`	Pfam	`PF00117`	GATase	Domain	122	308	1.1e-10	42.3	Glutamine amidotransferase class-I
`XP_057795986.1`	Pfam	`PF07722`	Peptidase_C26	Domain	87	304	7.3e-14	52.8	Peptidase C26
`XP_057795986.1`	Pfam	`PF00117`	GATase	Domain	122	305	7.7e-10	39.5	Glutamine amidotransferase class-I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940001.1
GACGTGTTGTTATGTACGATCGTCTTTCCTTGCGTAGCAACACAATTAACAAAATCACGCTGCCATTAAAAAACCCCCAAAACTCATCCATGTCAACGTTTCTTCAATCTCCTCCAATCAACACTTCCCCCTCTCCTCAGCGCCACCGCTCATGGCTCCACCACCGCCTCCTCCGCTCTCCACCTCAGACTCCACCGCCTCCGACTCGCCAGAATCCACGTCCTCTCCCGTCGACTCTTCTGCCTCTGGTATGCTAAACT...

XM_057940000.1
GACGTGTTGTTATGTACGATCGTCTTTCCTTGCGTAGCAACACAATTAACAAAATCACGCTGCCATTAAAAAACCCCCAAAACTCATCCATGTCAACGTTTCTTCAATCTCCTCCAATCAACACTTCCCCCTCTCCTCAGCGCCACCGCTCATGGCTCCACCACCGCCTCCTCCGCTCTCCACCTCAGACTCCACCGCCTCCGACTCGCCAGAATCCACGTCCTCTCCCGTCGACTCTTCTGCCTCTGGTATGCTAAACT...

CDS

7 records

下载 CDS FASTA

LOC131012086
ATGGCTCCACCACCGCCTCCTCCGCTCTCCACCTCAGACTCCACCGCCTCCGACTCGCCAGAATCCACGTCCTCTCCCGTCGACTCTTCTGCCTCTGGTATGCTAAACTACCGCCGGTTTCCCCTCCTCGTACCTCTCTGCAAAGAGCTCAGCGGCTCCGCCGCAGCTCAATCCACGGCTGCGCGGCAGCTCTTGCAAACTCAAACGGATGCTTCCGCTCCGAGAATCACCTCTGCCGGCCGCAATCTCAATTTCCGGCC...

Protein

7 records

下载 Protein FASTA

XP_057795980.1
MAPPPPPPLSTSDSTASDSPESTSSPVDSSASGMLNYRRFPLLVPLCKELSGSAAAQSTAARQLLQTQTDASAPRITSAGRNLNFRPVIGILSHPGDGASGRLNNAPNVSYIAASYSKFVESAGARVIPLIYNEPWEVLYGKLSLVNGVIFTGGWAKKGLYAEVVESIFKEVLRKNDAGDHYPLLAICLGFELVIKIVSEDNMILERFNAVDQASTLQFVENINMNGTVFHRFPPTLLKKLSTDCLVMQHHKQFGISPEK...

XP_057795981.1
MAPPPPPPLSTSDSTASDSPESTSSPVDSSASGMLNYRRFPLLVPLCKELSGSAAAQSTAARQLLQTQTDASAPRITSAGRNLNFRPVIGILSHPGDGASGRLNNAPNVSYIAASYSKFVESAGARVIPLIYNEPWEVLYGKLSLVNGVIFTGGWAKKGLYAEVVESIFKEVLRKNDAGDHYPLLAICLGFELVIKIVSEDNMILERFNAVDQASTLQFVENINMNGTVFHRFPPTLLKKLSTDCLVMQHHKFGISPEKF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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