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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001845`

染色体: Chr02 坐标: 33663062-33666804 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001845`
名称	SmilChr02G001845
描述	probable sugar phosphate/phosphate translocator At3g14410
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	33663062 - 33666804 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012094`
GeneID	`131012094`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012094`
原始查询	`SmilChr02G001845`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable sugar phosphate/phosphate translocator At3g14410
产物	probable sugar phosphate/phosphate translocator At3g14410
Arabidopsis	`AT3G14410` (AT3G14410) Nucleotide/sugar transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820663] identity=83.3; qcov=0.97; evalue=1.04e-166; confidence=high
Rice	`Os08g0135100` - identity=71.2; qcov=1.01; evalue=2.17e-151; confidence=high
GO	GO:0005768 (endosome); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0015297 (antiporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF03151 (TPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012094

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057795992.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795992.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795992.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795992.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795992.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:33663378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B8,C32,C53
`Chr2:33664012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:33664337`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C40
`Chr2:33664337`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795992.1

324 aa

162

324

TPT

PF03151 TPT 17-306 aa

XP_057795993.1

296 aa

148

296

TPT

PF03151 TPT 16-278 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795992.1`	Pfam	`PF03151`	TPT	Family	17	306	9.4e-26	91.6	Triose-phosphate Transporter family
`XP_057795993.1`	Pfam	`PF03151`	TPT	Family	16	278	4.7e-25	89.3	Triose-phosphate Transporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940009.1
GAGACTCAACAAGTCATGTGACCATTTTTAGAAAATAAGAGGTTATTGTGCACACTGCCAGCATGGCAACAAAGTTGCTGTCTCCTATCCAGCCAGGCTGCATGCTGATGTGTCTCGCTAATTTGCCATTCAAATCAGCAGCTCGTCTCGGCAAATTAACCAACACGTGGCATCAACGACCAATCACCGATAGCTAGGGCGTTGACTCACCCAGATTCTGAGGTGGCAATTCTCAGCTGTAAGCAAAAGGTTGTTAACGT...

XM_057940010.1
ATTGTGCACACTGCCAGCATGGCAACAAAGTTGCTGTCTCCTATCCAGCCAGGCTGCATGCTGATGTGTCTCGCTAATTTGCCATTCAAATCAGCAGCTCGTCTCGGCAAATTAACCAACACGTGGCATCAACGACCAATCACCGATAGCTAGGGCGTTGACTCACCCAGATTCTGAGGTGGCAATTCTCAGCTGTAAGCAAAAGGTTGTTAACGTCGTCGTTTCGCTTGAATCTTCTTCTCCTCTCAATTGGTCGTCCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012094
ATGGCGGATCGGTATACGAAATGGATGAAGGAAGAGTTCAAAACATATGCCTACATTCTCATCTACATCGCCCTCTCCAGCGGCCAGATATTCTTTAACAAGTGGGTTTTATCATCAAAGGAAATGAATTTCCCTTATCCTCTTGGATTAACGCTGCTTCACATGATATTCTCATCTGTTCTATGTTTTGTGGTTACCAAAGTTCTCAAGATCATGAAAGTTGAGGAAGGAATGACTTTGGATATATACATATGGTCTGT...

LOC131012094
ATGTGCCTGATTGAAGTGTGGGTTTTATCATCAAAGGAAATGAATTTCCCTTATCCTCTTGGATTAACGCTGCTTCACATGATATTCTCATCTGTTCTATGTTTTGTGGTTACCAAAGTTCTCAAGATCATGAAAGTTGAGGAAGGAATGACTTTGGATATATACATATGGTCTGTTGTCCCAATTGGTGGGATGTTTGCTATGACACTTTGGCTTGGGAACACTGCTTACCTCTACATATCTGTTGCCTTTGCTCAAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795992.1
MADRYTKWMKEEFKTYAYILIYIALSSGQIFFNKWVLSSKEMNFPYPLGLTLLHMIFSSVLCFVVTKVLKIMKVEEGMTLDIYIWSVVPIGGMFAMTLWLGNTAYLYISVAFAQMLKAIMPVAVFVLGVLAGLEVMNTRMLLIMSVISFGVLVASYGEISISWIGVVYQMGGVVGEALRLIFMEIFVKRKGLKLNPISMMYYVSPCSAVCLLIPWIFLEMPKMDARGTWSFKQPLILILNSLCTFALNISVFLVISHTSA...

XP_057795993.1
MCLIEVWVLSSKEMNFPYPLGLTLLHMIFSSVLCFVVTKVLKIMKVEEGMTLDIYIWSVVPIGGMFAMTLWLGNTAYLYISVAFAQMLKAIMPVAVFVLGVLAGLEVMNTRMLLIMSVISFGVLVASYGEISISWIGVVYQMGGVVGEALRLIFMEIFVKRKGLKLNPISMMYYVSPCSAVCLLIPWIFLEMPKMDARGTWSFKQPLILILNSLCTFALNISVFLVISHTSALTIRVAGVVKDWVVVLLSALIFADTTLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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