当前解析结果
SmilChr02G001846| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001846 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001846 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001846 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 33672121 - 33675345 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131012096 |
|---|---|
| GeneID | 131012096 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012096 |
| 原始查询 | SmilChr02G001846 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012096 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057795995.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057795995.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057795994.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795995.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795995.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:33672602 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B23,C10,C34,C70 |
Chr2:33672610 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,B52 |
Chr2:33672611 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A9,B35,B63,B83,C15 |
Chr2:33672613 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C65 |
Chr2:33672618 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr2:33672627 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 36 | A1,A14,A22,A7,A8,B105,B110,B127,B136,B139,B21,B22,B3,B32,B41,B47,B51,B58,B71,B74,B76,C17,C20,C22,C24,C26,C28,C30,C42,C44,C52,C59,C67,C78,C9,D9 |
Chr2:33672631 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,B120,B72,C52 |
Chr2:33672638 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A9,C2 |
Chr2:33672781 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D4 |
Chr2:33672782 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 55 | A16,A19,A2,A23,A24,A4,A7,B1,B107,B108,B110,B111,B12,B129,B134,B137,B139,B18,B22,B30,B33,B35,B45,B46,B48,B50,B55,B66,B70,B74,B75,B79,B8,B85,B86,B94,C1,C18,C23,C29,C30,C4,C40,C43,C50,C59,C62,C70,C73,C79,C83,C87,D10,D11,D3 |
Chr2:33672793 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B38,B39,C18 |
Chr2:33672804 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B114,B126,B76,C41 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
15 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。