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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001850`

染色体: Chr02 坐标: 33730225-33730871 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001850`
名称	SmilChr02G001850
描述	uncharacterized SmilChr02G001850
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	33730225 - 33730871 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008332`
GeneID	`131008332`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008332`
原始查询	`SmilChr02G001850`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008332

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791197.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057791197.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057791197.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057791197.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791197.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:33730235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr2:33730335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B94,D3
`Chr2:33730426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B58,C13,C24,C31
`Chr2:33730438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,C43
`Chr2:33730471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B60,B91,C5,D2
`Chr2:33730476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr2:33730527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	33	A3,B10,B122,B130,B140,B2,B34,B40,B55,B56,B60,B61,B66,B67,B69,B73,B74,B75,B77,B78,B84,B86,B91,B98,C14,C20,C21,C29,C5,C67,C7,D2,D4
`Chr2:33730572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B133,B29,B67,C46
`Chr2:33730573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C62
`Chr2:33730581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C72
`Chr2:33730584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	68	A1,A14,A20,A3,A4,A5,B104,B106,B110,B117,B120,B121,B124,B133,B138,B139,B17,B19,B21,B29,B30,B32,B47,B50,B60,B68,B70,B71,B72,B81,B82,B87,B88,B89,B95,B98,C1,C12,C14,C16,C21,C23,C24,C25,C26,C29,C3,C34,C36,C44,C45,C46,C49,C54,C57,C6,C60,C61,C63,C70,C71,C73,C87,D11,D2,D4,D7,D9
`Chr2:33730602`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	46	A19,A20,B1,B103,B106,B108,B125,B128,B131,B132,B136,B140,B21,B26,B30,B35,B4,B42,B5,B52,B57,B64,B68,B7,B85,B87,C10,C16,C17,C18,C2,C20,C23,C32,C36,C41,C5,C50,C66,C68,C7,C78,C84,C86,D11,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791197.1

188 aa

188

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 36-175 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791197.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	36	175	1.4e-07	32.3	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935214.1
ATGGTTGATGGTTGGGAGCCTGAGATAGACTGGATCTGCCAAGTACGTGGAAAATCACTTAAGGGCCATGAACTTCCTCCTGGTCATATAGGATGGATGGATGCCACACAGGTTCTCATGCCAGTCATAATTGGCCACCATTTTATCCTATGTCGGATTCGGTTAGGAGAAGCCGTTTGCGAGGTCTATGACCCAGTATTCCACAAGCTAACACCTCGACAACAGGATGCTCGAGTTGGTGATTTACTACCTTTACTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008332
ATGGTTGATGGTTGGGAGCCTGAGATAGACTGGATCTGCCAAGTACGTGGAAAATCACTTAAGGGCCATGAACTTCCTCCTGGTCATATAGGATGGATGGATGCCACACAGGTTCTCATGCCAGTCATAATTGGCCACCATTTTATCCTATGTCGGATTCGGTTAGGAGAAGCCGTTTGCGAGGTCTATGACCCAGTATTCCACAAGCTAACACCTCGACAACAGGATGCTCGAGTTGGTGATTTACTACCTTTACTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791197.1
MVDGWEPEIDWICQVRGKSLKGHELPPGHIGWMDATQVLMPVIIGHHFILCRIRLGEAVCEVYDPVFHKLTPRQQDARVGDLLPLLRLLPAVLQVSRWLDDTSIDSTVAKNKWPLMTAEFAPAEVQFHQQDSVSCGPFVCMYAERLISGSPSIEWGNSNVAAYRSKIARSIFSLCETWTARCDCLGLT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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