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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001865`

染色体: Chr02 坐标: 33884267-33884842 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001865`
名称	SmilChr02G001865
描述	egg cell-secreted protein 1.2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	33884267 - 33884842 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012107`
GeneID	`131012107`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012107`
原始查询	`SmilChr02G001865`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	egg cell-secreted protein 1.2-like
产物	egg cell-secreted protein 1.2-like
Arabidopsis	`AT2G21750` (EC1.3) Egg cell-secreted protein (DUF1278) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816712] identity=50; qcov=0.859; evalue=1.43e-31; confidence=medium
Rice	`Os11g0168000` - identity=50.8; qcov=0.508; evalue=6.64e-24; confidence=medium
GO	GO:0009567 (double fertilization forming a zygote and endosperm)
KEGG	-
Pfam	PF05617 (Prolamin_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012107

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057796005.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057796005.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796005.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796005.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796005.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:33884380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:33884487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C86
`Chr2:33884498`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B122
`Chr2:33884498`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B122
`Chr2:33884566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,C46,C72,C87
`Chr2:33884687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B43
`Chr2:33884698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796005.1

128 aa

128

Prolamin_like

PF05617 Prolamin_like 39-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796005.1`	Pfam	`PF05617`	Prolamin_like	Domain	39	103	5.8e-18	65.5	Prolamin-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940022.1
CACCATCTTTCCCCTATATATATAATATAAATCTTCCCATTTCTCCACAACACCAAGTATCACGCATATCTATTCACTACAAAAAACATGGCTAAGCTCGTCGCAGTTGTCGTCGTTGGTCTTGTAGCATCATCCCTCATGGCCATGGTCTCGGCAAGAAATTTAGCAGCGCGTCTGAAAGTGGCGGAAGAGGGGCCTAGCACGTGCTGGGATGCGTTGTCGGAGCTTCAATCCTGCAGCGCAGAAGTGGTTATGTTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012107
ATGGCTAAGCTCGTCGCAGTTGTCGTCGTTGGTCTTGTAGCATCATCCCTCATGGCCATGGTCTCGGCAAGAAATTTAGCAGCGCGTCTGAAAGTGGCGGAAGAGGGGCCTAGCACGTGCTGGGATGCGTTGTCGGAGCTTCAATCCTGCAGCGCAGAAGTGGTTATGTTCTTCCTTAATGGGGAGACTCAGCTGGGCGCCAACTGCTGCGCCGCCATAGGAGTCATTGAGCATCAGTGCTGGCCCTCCATGCTCGGAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796005.1
MAKLVAVVVVGLVASSLMAMVSARNLAARLKVAEEGPSTCWDALSELQSCSAEVVMFFLNGETQLGANCCAAIGVIEHQCWPSMLGTLGITTEEGNVLRGYCDATNSATASAPASSLDQCYNFPRLQN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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