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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001868`

染色体: Chr02 坐标: 33959567-33960337 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001868`
名称	SmilChr02G001868
描述	uncharacterized SmilChr02G001868
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	33959567 - 33960337 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008340`
GeneID	`131008340`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008340`
原始查询	`SmilChr02G001868`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=26.6; qcov=0.617; evalue=7.51e-09; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=29.5; qcov=0.742; evalue=3.44e-17; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008340

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791207.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057791207.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791207.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791207.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791207.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:33959623`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A10,A5,B102,B105,B106,B12,B123,B13,B132,B18,B32,B46,B55,B58,B63,B89,B93,B94,B96,C31,C34,C35,C6,C67,C73,D4
`Chr2:33959625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B43
`Chr2:33959651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B104,B119,B123,B44,B53,B58,B94,C31,C36,C84
`Chr2:33959655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B13,C26,C5
`Chr2:33959658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A21
`Chr2:33959658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:33959690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,D11
`Chr2:33959703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B19,B27,C60
`Chr2:33959714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C49
`Chr2:33959721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:33959723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B110,C20
`Chr2:33959730`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A11,A24,B100,B102,B117,B128,B131,B135,B136,B2,B40,B44,B49,B57,B61,B74,B82,C21,C28,C44,C51,C53,C55,C63,C71,C8,C9,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791207.1

256 aa

128

256

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 57-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791207.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	57	151	3.3e-16	60.4	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935224.1
ATGGGAAGATGGGAGGAAGGAAGTTGGGTTTGGAAGTTTGAATGGAGAAGGGAGTTGTTTGATAGAGAGAAAGAAATGTTTGATATACTAACTGCTTTCATTTCAGAATTTGATCTCTGCCCAGATAAGGAGGATGGCTGGATTTGGAAGGCGACAAAGGACGGGGTTTTTTCAACCAAGTCGGCGTATGAAGTTTTAGCAGCGGCCAGGAACGAACCATCTCCGTTGTCCATGTTTAAAGAAGAGTTAGCTCAAGTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008340
ATGGGAAGATGGGAGGAAGGAAGTTGGGTTTGGAAGTTTGAATGGAGAAGGGAGTTGTTTGATAGAGAGAAAGAAATGTTTGATATACTAACTGCTTTCATTTCAGAATTTGATCTCTGCCCAGATAAGGAGGATGGCTGGATTTGGAAGGCGACAAAGGACGGGGTTTTTTCAACCAAGTCGGCGTATGAAGTTTTAGCAGCGGCCAGGAACGAACCATCTCCGTTGTCCATGTTTAAAGAAGAGTTAGCTCAAGTTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791207.1
MGRWEEGSWVWKFEWRRELFDREKEMFDILTAFISEFDLCPDKEDGWIWKATKDGVFSTKSAYEVLAAARNEPSPLSMFKEELAQVWKTPAPHKAKVTAWRCLRNRLATCNNLVKRNVTLGIEETWCNACVTSVETAEHLFLHCPKVEIVWDKLQQWIDRKTVRPQGIPQHFTSFFCATKGKNNRRFLMAVWVCTIWLIWKKRNDSRFEGKAWDIEKLIIEIKGRLWSWNKIFKIVDSNIPFSTWCSRGFSLPFLY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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