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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001873`

染色体: Chr02 坐标: 34016311-34021212 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001873`
名称	SmilChr02G001873
描述	endoplasmic reticulum oxidoreductin-1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	34016311 - 34021212 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012115`
GeneID	`131012115`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012115`
原始查询	`SmilChr02G001873`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endoplasmic reticulum oxidoreductin-1-like
产物	endoplasmic reticulum oxidoreductin-1-like
Arabidopsis	`AT1G72280` (ERO1) endoplasmic reticulum oxidoreductins 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843560] identity=76.7; qcov=0.874; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0733800` (ERO1) - identity=79.1; qcov=0.832; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0015035 (protein-disulfide reductase activity); GO:0016972 (thiol oxidase activity); GO:0034975 (protein folding in endoplasmic reticulum); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04137 (ERO1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012115

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057796009.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057796009.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796009.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796009.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796009.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:34016908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B45,C43,C53,C68
`Chr2:34018688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:34019903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:34020038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C37
`Chr2:34020726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B13,B35,B62,C36
`Chr2:34020750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr2:34020751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B117,C24,C27
`Chr2:34020904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B109,B139,B2,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796009.1

477 aa

238

477

ERO1

PF04137 ERO1 86-434 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796009.1`	Pfam	`PF04137`	ERO1	Family	86	434	1.5e-120	403.3	Endoplasmic Reticulum Oxidoreductin 1 (ERO1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940026.1
CTCTCTCAAAATCTATGTGGCATAATCGAGAACTGTTATTGGCTGCATCTGCGTCACGTTTACTAAAATCTTTGGCGCGTTAATTCGTCGTAAGCCTTCCATTCGCCCTTCTCCTGTGAGCGTTGCGTCTCGGGTGAATCGTGTGCATCACGCGGAATCACAACTCGACACGTATCGCAATCTCCCGTATTTGACTGCCACGCGCCACCGCCACGGGGTGGGGATCCTTTTACAAACGTCCACCATCCCCGACCGAAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012115
ATGGCCGAAGCTAAAGCTGTTGGTGGTGGTAAGAAAAAACAGTTGAAGAAATCGAAACAGGGAAAAGGTGGAATGAGGAAATTGGCATCAATTGGGGCAGCTTTGGTGGTGGTGGTGGTAGCCATTGCTATAACGTACAATCATGCTCAAATTCACAAGTCTTGCCATTGTTCTCAGGATGCTCGTAAGTATACTGGCATTGTTGAGGACTGTTGTTGTGATTATGAGACAGTGGATAGTGTTAATGGGGATGTACTACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796009.1
MAEAKAVGGGKKKQLKKSKQGKGGMRKLASIGAALVVVVVAIAITYNHAQIHKSCHCSQDARKYTGIVEDCCCDYETVDSVNGDVLHPLLQDLVRTPFFRYFKVKLWCDCPFWPDDGMCKLRDCSVCECPENEFPEPFKRPIQYGLPSDDLKCQEGKPQAAVDRTLDSKAFRGWIEVDNPWTLDDETDNSEMTYVNLQLNPERYTGYTGPSARRIWDAIYSENCPKYPSGEICQEKKVLYKLISGLHSSISIHIAADYLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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