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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001880`

染色体: Chr02 坐标: 34122199-34123408 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001880`
名称	SmilChr02G001880
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	34122199 - 34123408 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008344`
GeneID	`131008344`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008344`
原始查询	`SmilChr02G001880`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G15090` (FAR1) FRS (FAR1 Related Sequences) transcription factor family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827173] identity=24.1; qcov=0.8; evalue=7.43e-12; confidence=weak
Rice	`Os06g0166100` - identity=31.1; qcov=0.881; evalue=6.07e-28; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008344

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791210.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791210.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791210.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791210.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791210.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:34122248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,D10
`Chr2:34122275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:34122306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D10
`Chr2:34122306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:34122331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C5,C58
`Chr2:34122331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C58
`Chr2:34122381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C41
`Chr2:34122395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B8
`Chr2:34122452`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C8
`Chr2:34122452`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C8
`Chr2:34122507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B71,B84
`Chr2:34122656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791210.1

295 aa

148

295

FAR1

PF03101 FAR1 102-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791210.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	102	173	2.7e-09	38.3	FAR1 DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935227.1
ATGGCGGATGTAGACCAGAATGGAGGAGCAGACCAGCCCCATGAGCTGACTTTGAGGGAGATGATGTACCCCAACAACATGAGCCTGAGGCCTCTGGGCATCACTTTGCCCACGATCACTGACAATTGGGAGTTGAGTTCCTTGAGAGATACTTCCCTGCATCACGAGGTTGAAGATGTTGAATTTGAATTTGTCCATGAGGTTGAAGATGTGGCGAATGAATTTGTTACTTCAACTGCTATAGAGTTGGAGGAGAAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008344
ATGGCGGATGTAGACCAGAATGGAGGAGCAGACCAGCCCCATGAGCTGACTTTGAGGGAGATGATGTACCCCAACAACATGAGCCTGAGGCCTCTGGGCATCACTTTGCCCACGATCACTGACAATTGGGAGTTGAGTTCCTTGAGAGATACTTCCCTGCATCACGAGGTTGAAGATGTTGAATTTGAATTTGTCCATGAGGTTGAAGATGTGGCGAATGAATTTGTTACTTCAACTGCTATAGAGTTGGAGGAGAAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791210.1
MADVDQNGGADQPHELTLREMMYPNNMSLRPLGITLPTITDNWELSSLRDTSLHHEVEDVEFEFVHEVEDVANEFVTSTAIELEEKLAPRCLVDGVDQAFLLYCAYAKHTVFSVRKGNQERFGQTKVVLIKTFVCSYCGLTPTAHINGRLAVYKKYSTRCNCEALLRVARVKGWPWKKSMLEALNSTGIPISRACRFMENEAGGPENVGFIRRDVYHHMDNVRRKSKMADGDSTALMQYFVDKSNKETFFYWNMQKDDEG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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