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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001887`

染色体: Chr02 坐标: 34177415-34179319 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001887`
名称	SmilChr02G001887
描述	uncharacterized SmilChr02G001887
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	34177415 - 34179319 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012126`
GeneID	`131012126`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012126`
原始查询	`SmilChr02G001887`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=21.1; qcov=0.764; evalue=6e-08; confidence=weak
Rice	`Os04g0590366` - identity=33.1; qcov=0.4; evalue=3.63e-22; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012126

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796019.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796019.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796019.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796019.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796019.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:34177585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,C87
`Chr2:34177609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,C60,D4
`Chr2:34177619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,C77
`Chr2:34177623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A7,B101,B105,B11,B113,B13,B29,B44,B46,B53,B66,B68,B86,B95,C16,C25,C30,C34,C4,C71,C8,D2,D5
`Chr2:34177628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B58
`Chr2:34177633`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B51
`Chr2:34177633`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B51
`Chr2:34177655`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A19,B106,B118,B12,B121,B126,B30,B34,B40,B51,B59,B78,B86,B87,C17,C24,C33,C46,C50,C55,C63,C71,C80,D8
`Chr2:34177658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B53
`Chr2:34177668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B19,B37,B6,C63
`Chr2:34177670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr2:34177715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940036.1
TATGCAATTTACCCAAACTTAAGGAAATATTTAACTGGACTGAGGGGCTATGTTGTATAATATTTCGTTTGATAACCATAAAGTTAAAAGCGGTTTACGCGTTTCTTGTGTTTGGTAAATAGTGCTGCAAATTGGTATATCATGTGTAATGTCTGAATTACCCTTACTAACATTTAGAAATTCCATCCCGTATCCTTGCATCTCCCGCCGATTCAGCCATTTGGGGGGAACCAAAAATTGTGGGGGGAAATTGGAGTTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012126
ATGTCTGAATTACCCTTACTAACATTTAGAAATTCCATCCCGTATCCTTGCATCTCCCGCCGATTCAGCCATTTGGGGGGAACCAAAAATTGTGGGGGGAAATTGGAGTTTATATATTGCAAAGCAAAGAACCCATGGACTTCAAACCTTTCGCTTCCTCTTCGAGACATCGTGGGTCATCAAGCAGAGGCGATTATCAGAGACGAACATACTCATATCGAGATGAGTTCGCCGCACCAAGTAGGTAGCGACTGCATTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796019.1
MSELPLLTFRNSIPYPCISRRFSHLGGTKNCGGKLEFIYCKAKNPWTSNLSLPLRDIVGHQAEAIIRDEHTHIEMSSPHQVGSDCIPSRVNKTKKTRRSWTCKEEETMLNGLKELVVQGWKSDNGFRAGYLAKLEDVMKTAFPGTDLKGVPHINSKIAAWKRNYNSLCTMLSYTGAGFNGDHMIDVTNEQWAQICRADRNAELMRYKSWPMFDAWKEVFGKDRATGEHAEDLMDAVNDMYRAGNVAENTHEEESDVNLDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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