当前解析结果
SmilChr02G001894| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001894 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001894 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001894 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 34244680 - 34245578 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131012130 |
|---|---|
| GeneID | 131012130 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012130 |
| 原始查询 | SmilChr02G001894 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012130 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057796023.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.40000 | XP_057796023.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057796023.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057796023.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796023.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:34244814 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B29,C5 |
Chr2:34244816 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B22 |
Chr2:34244817 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:34244838 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B63,C25 |
Chr2:34244852 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,B75 |
Chr2:34244853 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B34,B42,B43,B64,B89 |
Chr2:34244952 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr2:34244953 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B23,B33,C64 |
Chr2:34244973 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B11,B27,C34,C56 |
Chr2:34244982 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B112,B131,C35,D11,D3 |
Chr2:34244984 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B12,B5,B83,B93 |
Chr2:34244985 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A19 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。