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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001900`

染色体: Chr02 坐标: 34282552-34284705 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001900`
名称	SmilChr02G001900
描述	receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g78530
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	34282552 - 34284705 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012134`
GeneID	`131012134`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012134`
原始查询	`SmilChr02G001900`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g78530
产物	receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g78530
Arabidopsis	`AT1G78530` (AT1G78530) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844189] identity=69.7; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0247500` (OsRLCK27) - identity=62; qcov=0.969; evalue=7.91e-166; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012134

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057796028.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796028.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796028.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796028.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796028.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:34282739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr2:34282740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,B89,C62,C85
`Chr2:34283485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:34283626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,B89,C62,C85
`Chr2:34283813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C33
`Chr2:34283863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr2:34283893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B26,B3,C5
`Chr2:34284091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796028.1

353 aa

176

353

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 74-339 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 74-341 aa

XP_057796029.1

353 aa

176

353

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 74-339 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 74-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796028.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	74	339	1.6e-46	159.6	Protein kinase domain
`XP_057796028.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	74	341	1.9e-46	159.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057796029.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	74	339	1.6e-46	159.6	Protein kinase domain
`XP_057796029.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	74	341	1.9e-46	159.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940045.1
ATTTTAATTTTATTATTGGAATTTCGCTGTTTGTAGTCAGAGACAATCAAAGTTTGTTTCTCCACCCTGTTGGCTGTAGAGAAGATTAAAAAGACAGATTGGATACTGCTGCAATTCAGCCACAAAACCAGATGGGAAGAAACATAGCATTATACGTCTCCATTTCTGTTATTGCCTTTGTCATCTCAAAGATCATCATGGCAGTCCTCTGCCACCGTCGCTGGAAACAAAGGCACTTGCTTATCCAAGATAGTTTCAGA...

XM_057940046.1
GCTCCGAAATGCTACATAATTATAGTCTAACACGGGCATGCCGATGCCATCATCACTTTCTAATAATGTCTGCAAATTAATTGGGCATTCACATGCTTTTGTTTCTCCACCCTGTTGGCTGTAGAGAAGATTAAAAAGACAGATTGGATACTGCTGCAATTCAGCCACAAAACCAGATGGGAAGAAACATAGCATTATACGTCTCCATTTCTGTTATTGCCTTTGTCATCTCAAAGATCATCATGGCAGTCCTCTGCCAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012134
ATGGGAAGAAACATAGCATTATACGTCTCCATTTCTGTTATTGCCTTTGTCATCTCAAAGATCATCATGGCAGTCCTCTGCCACCGTCGCTGGAAACAAAGGCACTTGCTTATCCAAGATAGTTTCAGAGGGGGGAAACTGGTGCTGTTTACATCACCCAGGATCAAATCATTGAAAACAGACGTGTTTCTGAAGAAGACGATGAAGCTCGGCAACAGGGATATCATTGGATCAGGCGGCTTTGGGACGGTTTACAAGCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796028.1
MGRNIALYVSISVIAFVISKIIMAVLCHRRWKQRHLLIQDSFRGGKLVLFTSPRIKSLKTDVFLKKTMKLGNRDIIGSGGFGTVYKLMIDDCIPFAVKRLNRLGAADQDRSFQRELEAMGDIKHRNVVTLHGYYTAPHYNLLIYELMPNGSLDAVLHGKSMNKMVLDWPTRYKIAVGAARGISYLHHDCIPHIIHRDIKTSNILLDHNLEARVSDFGLATLMEPDKTHVSTLAAGTFGYLAPEYFDTGKATAKGDVYSFG...

XP_057796029.1
MGRNIALYVSISVIAFVISKIIMAVLCHRRWKQRHLLIQDSFRGGKLVLFTSPRIKSLKTDVFLKKTMKLGNRDIIGSGGFGTVYKLMIDDCIPFAVKRLNRLGAADQDRSFQRELEAMGDIKHRNVVTLHGYYTAPHYNLLIYELMPNGSLDAVLHGKSMNKMVLDWPTRYKIAVGAARGISYLHHDCIPHIIHRDIKTSNILLDHNLEARVSDFGLATLMEPDKTHVSTLAAGTFGYLAPEYFDTGKATAKGDVYSFG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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