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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001903`

染色体: Chr02 坐标: 34340199-34342756 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001903`
名称	SmilChr02G001903
描述	fatty-acid-binding protein 3, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	34340199 - 34342756 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012137`
GeneID	`131012137`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012137`
原始查询	`SmilChr02G001903`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fatty-acid-binding protein 3, chloroplastic-like
产物	fatty-acid-binding protein 3%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G53520` (FAP3) Chalcone-flavanone isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841787] identity=67.4; qcov=0.689; evalue=5.8e-81; confidence=high
Rice	`Os02g0320300` - identity=46.3; qcov=0.689; evalue=5.43e-46; confidence=medium
GO	GO:0005504 (fatty acid binding); GO:0006631 (fatty acid metabolic process); GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0016872 (intramolecular lyase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02431 (Chalcone); PF16035 (Chalcone_2); PF16036 (Chalcone_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012137

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057796032.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057796032.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796032.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796032.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796032.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:34341094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr2:34341145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B20
`Chr2:34341285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B74,C67
`Chr2:34342460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B61
`Chr2:34342610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C62,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796032.1

288 aa

144

288

Chalcone

Chalcone_2

Chalcone_3

PF02431 Chalcone 92-283 aa PF16035 Chalcone_2 107-279 aa PF16036 Chalcone_3 153-277 aa

XP_057796033.1

254 aa

127

254

Chalcone_2

Chalcone

Chalcone_3

PF16035 Chalcone_2 87-245 aa PF02431 Chalcone 90-249 aa PF16036 Chalcone_3 119-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796032.1`	Pfam	`PF02431`	Chalcone	Domain	92	283	1.2e-19	71.3	Chalcone-flavanone isomerase
`XP_057796032.1`	Pfam	`PF16035`	Chalcone_2	Domain	107	279	1e-11	45.8	Chalcone isomerase like
`XP_057796032.1`	Pfam	`PF16036`	Chalcone_3	Domain	153	277	7.4e-13	49.6	Chalcone isomerase-like
`XP_057796033.1`	Pfam	`PF16035`	Chalcone_2	Domain	87	245	2.2e-09	38.1	Chalcone isomerase like
`XP_057796033.1`	Pfam	`PF02431`	Chalcone	Domain	90	249	3.7e-17	63.2	Chalcone-flavanone isomerase
`XP_057796033.1`	Pfam	`PF16036`	Chalcone_3	Domain	119	243	1.9e-09	38.5	Chalcone isomerase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940049.1
TTATTTTAATGCAACTCGGATTTAGAAGTACTAATCTTCTGACAAATTCTGTCTCACACACACAATGGCGTCAACAGTTGCAGGAAGTGTTCCCTATTCATCACTCACCACTCCCAAACCCTCGGATCTAAACCCCAAAATCTACTCTCTTGCACACAATCCAAACAATCCGCCATCACCACTCAATTGCAGCAACCAATCCTTCTCCCCTCATTCCGCATTTCGTTCTCGCGTCTGCATCAACAAAAATGCTCGACCCC...

XM_057940050.1
TAATGCAACTCGGATTTAGAAGTACTAATCTTCTGACAAATTCTGTCTCACACACACAATGGCGTCAACAGTTGCAGGAAGTGTTCCCTATTCATCACTCACCACTCCCAAACCCTCGGATCTAAACCCCAAAATCTACTCTCTTGCACACAATCCAAACAATCCGCCATCACCACTCAATTGCAGCAACCAATCCTTCTCCCCTCATTCCGCATTTCGTTCTCGCGTCTGCATCAACAAAAATGCTCGACCCCGCAGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012137
ATGGCGTCAACAGTTGCAGGAAGTGTTCCCTATTCATCACTCACCACTCCCAAACCCTCGGATCTAAACCCCAAAATCTACTCTCTTGCACACAATCCAAACAATCCGCCATCACCACTCAATTGCAGCAACCAATCCTTCTCCCCTCATTCCGCATTTCGTTCTCGCGTCTGCATCAACAAAAATGCTCGACCCCGCAGCCGCTTCTCGCCAATTGTCTATTCTTCTTCTCCAGGATACAGGGAAAAAGTGTTCGCTAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796032.1
MASTVAGSVPYSSLTTPKPSDLNPKIYSLAHNPNNPPSPLNCSNQSFSPHSAFRSRVCINKNARPRSRFSPIVYSSSPVVSSEYLEEPQTKVKYQTSLSLPGCSSSLSLLGTGYREKVFAIIGVKVYAAGLYANPSIFSKLDAWKRRSSAELQKDSSLFDAIYQAPLEKSLHIILVRDLDGKTFWDALDEALSPRIKSPTPVDESALSTFRGIFQGRPLQKGTSIFLTWLDMEKMLVFVTPEGIPSSVDATIESSNVTSA...

XP_057796033.1
MASTVAGSVPYSSLTTPKPSDLNPKIYSLAHNPNNPPSPLNCSNQSFSPHSAFRSRVCINKNARPRSRFSPIVYSSSPGYREKVFAIIGVKVYAAGLYANPSIFSKLDAWKRRSSAELQKDSSLFDAIYQAPLEKSLHIILVRDLDGKTFWDALDEALSPRIKSPTPVDESALSTFRGIFQGRPLQKGTSIFLTWLDMEKMLVFVTPEGIPSSVDATIESSNVTSALFDVFLGGNPVSPSLKASACEGLAAALK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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