当前解析结果
SmilChr02G001909| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001909 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001909 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001909 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 34382304 - 34384043 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008352 |
|---|---|
| GeneID | 131008352 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008352 |
| 原始查询 | SmilChr02G001909 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os10g0443400; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os10g0443400; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT3G42170 (DAYSLEEPER)BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=41.6; qcov=0.34; evalue=6.67e-19; confidence=low |
| Rice | Os10g0443400- identity=45.8; qcov=0.45; evalue=3.99e-28; confidence=medium |
| GO | GO:0003677 (DNA binding); GO:0046983 (protein dimerization activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02892 (zf-BED); PF05699 (Dimer_Tnp_hAT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008352 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057791219.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791219.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791219.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791219.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057791219.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057791219.1PF02892
zf-BED 61-91 aa
PF05699
Dimer_Tnp_hAT 130-211 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057791219.1 |
Pfam | PF02892 |
zf-BED | Domain | 61 | 91 | 4.9e-05 | 24.0 | BED zinc finger |
XP_057791219.1 |
Pfam | PF05699 |
Dimer_Tnp_hAT | Domain | 130 | 211 | 5.5e-29 | 100.5 | hAT family C-terminal dimerisation region |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。