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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001920`

染色体: Chr02 坐标: 34609913-34611689 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001920`
名称	SmilChr02G001920
描述	serine/threonine-protein kinase WAG1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	34609913 - 34611689 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012155`
GeneID	`131012155`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012155`
原始查询	`SmilChr02G001920`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase WAG1-like
产物	serine/threonine-protein kinase WAG1-like
Arabidopsis	`AT3G14370` (WAG2) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820658] identity=62.9; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0253200` - identity=54.4; qcov=0.746; evalue=5.16e-129; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012155

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057796057.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057796057.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796057.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796057.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796057.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:34610230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B139,B16,C56,D6
`Chr2:34610486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr2:34610584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B2,C42
`Chr2:34610767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B41,B8
`Chr2:34611088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B59,C67
`Chr2:34611103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr2:34611166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B140
`Chr2:34611178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr2:34611334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr2:34611357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,C34,C56,C81
`Chr2:34611436`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C62
`Chr2:34611436`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796057.1

476 aa

238

476

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 100-253 aa PF00069 Pkinase 102-399 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 293-347 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796057.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	100	253	1.3e-32	113.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057796057.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	102	399	6.7e-59	200.1	Protein kinase domain
`XP_057796057.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	293	347	1.3e-32	113.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940074.1
TCACTAAACCTAACTTATCACCCTCTTTAATTATCTCTCCTCTACTGTTAGCGTCAACTAATTACGTTATAATTAATTAATAATACATCGCAGCTGCATTGCCTATATAAAGCAAGCATCTCATGCAACCCACAACGCCAAAGAAAGAAACCCTCGAACGAAAATATGGATCAAGAAGAGTCCATCTACAGCTACTACTTAGCAGCAGACTCCGATTTAGACCTGAGCTTCACCTCCGTCACCACCGCCACCACTGACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012155
ATGGATCAAGAAGAGTCCATCTACAGCTACTACTTAGCAGCAGACTCCGATTTAGACCTGAGCTTCACCTCCGTCACCACCGCCACCACTGACCGCACCCTCTCCGCCCGCAGCAGCTTAGCCCGGAGCAGCCTCACCCTCAGCTTCAACGAGTCCCGCCTCTCCACCGCCTCCACCACCTCCACCGCCGTCCCCAACGTCCACCACCGCCCCCACCGCCGCCACGACAACCCCAACTGGGCGGCCGTGAACGCCGCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796057.1
MDQEESIYSYYLAADSDLDLSFTSVTTATTDRTLSARSSLARSSLTLSFNESRLSTASTTSTAVPNVHHRPHRRHDNPNWAAVNAATTLSADGALHLRHLKLLKLVGAGNLGRVFLCRLRDYEHANFALKVVDRDSLSSKKISHVQTEAQILSSLDHPFLPTLYAHIEVSHYICLLMDYCPNGDLHALLRKQPYNRLPLQAVRFFAAEVLLALEYLHAQGIVYRDLKPENILIREDGHIMLSDFDLCFNSDISPKLESRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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