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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001921`

染色体: Chr02 坐标: 34615093-34616120 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001921`
名称	SmilChr02G001921
描述	uncharacterized SmilChr02G001921
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	34615093 - 34616120 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008358`
GeneID	`131008358`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008358`
原始查询	`SmilChr02G001921`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0328500` - identity=34.4; qcov=0.486; evalue=9.67e-23; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008358

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791224.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791224.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791224.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791224.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791224.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:34615120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B26,B61,B8
`Chr2:34615121`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	25	A21,A23,B103,B117,B2,B25,B26,B28,B47,B57,B82,B90,B92,C16,C27,C31,C46,C52,C56,C65,C70,C84,C87,D4,D5
`Chr2:34615130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:34615139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,B89,C62,D11
`Chr2:34615141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:34615147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:34615154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B66
`Chr2:34615169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B124,C48,C78,C87
`Chr2:34615215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B77,B91,D2,D3
`Chr2:34615216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:34615222`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	88	A1,A11,A15,A19,A21,A22,A24,A6,A8,B101,B104,B107,B108,B11,B115,B123,B124,B125,B127,B13,B132,B137,B138,B14,B15,B17,B18,B20,B21,B22,B28,B29,B33,B36,B41,B42,B43,B45,B46,B5,B51,B52,B58,B59,B62,B65,B66,B7,B71,B74,B76,B78,B80,B93,B94,B95,C17,C18,C2,C22,C23,C24,C25,C3,C31,C36,C39,C45,C46,C50,C52,C53,C54,C55,C57,C58,C6,C60,C65,C70,C72,C74,C79,C85,C87,D1,D11,D5
`Chr2:34615225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B139,B37,B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791224.1

311 aa

156

311

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 13-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791224.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	13	110	9.5e-09	36.8	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935241.1
CACCGAAACTGCTCGCATGGGCCGTGTCAACAAGACGGACCAAAAGCGCCGGAGCTGGTCTCTTAGAGAAGAAGAAGTTCTAATCACTGCATTGAAAGAACTCGTTGCACTTGGCTGGAAATCCGACAATGGGTTCCGAGCCGGCTATTTGAATAAGCTTGAGGAGGCTTTGAAGAAGGAATTTCCGAATACTGACCTCAAGGGAATGCCTCACATTAACTCGAAGGTGACAACTTGGAAAAAGACATGGGGATCACTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008358
ATGGGCCGTGTCAACAAGACGGACCAAAAGCGCCGGAGCTGGTCTCTTAGAGAAGAAGAAGTTCTAATCACTGCATTGAAAGAACTCGTTGCACTTGGCTGGAAATCCGACAATGGGTTCCGAGCCGGCTATTTGAATAAGCTTGAGGAGGCTTTGAAGAAGGAATTTCCGAATACTGACCTCAAGGGAATGCCTCACATTAACTCGAAGGTGACAACTTGGAAAAAGACATGGGGATCACTGTGGAAAATCCTCAAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791224.1
MGRVNKTDQKRRSWSLREEEVLITALKELVALGWKSDNGFRAGYLNKLEEALKKEFPNTDLKGMPHINSKVTTWKKTWGSLWKILKTNGVGFNVNGKHMIDCDDEQWDNFVRVDTSVRNFRYKSWPFVEDWKLIFGMDRANGDEAEDLMEAAHDMYRKLDINQPLEDSEYHVSLEDICENGETGDNTGDNVSQTQGREESLVAEKEATTSSKKRRRSSAFDDRFFEALANIGRGTESRLDTISSRMGYDYDISKARKAVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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