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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr02G001938

染色体: Chr02 坐标: 34831960-34835432 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr02G001938
名称SmilChr02G001938
描述probable sugar phosphate/phosphate translocator At3g14410
染色体 / SeqIDChr02 / NC_080388.1
坐标与链方向34831960 - 34835432 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131012162
GeneID131012162
locus_tag-
NCBI NameLOC131012162
原始查询SmilChr02G001938

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述probable sugar phosphate/phosphate translocator At3g14410
产物probable sugar phosphate/phosphate translocator At3g14410
ArabidopsisAT3G14410 (AT3G14410)
Nucleotide/sugar transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820663]
identity=82.9; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
RiceOs08g0135100
-
identity=71.2; qcov=0.985; evalue=8.21e-163; confidence=high
GOGO:0005768 (endosome); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0015297 (antiporter activity)
KEGG-
PfamPF03151 (TPT)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131012162

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Golgi apparatus 高尔基体 1.00000 XP_057796064.1
2 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057796064.1
3 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057796064.1
4 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057796064.1
5 Chromatin 染色质 0.00000 XP_057796064.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796064.1
324 aa
N
1
162
324
TPT
C
PF03151 TPT 17-306 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057796064.1 Pfam PF03151 TPT Family 17 306 7.3e-26 91.9 Triose-phosphate Transporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057940081.1
TCCTCTCAATTGGTCGTCCAGTTAAGACGCCGTTAACTTCCCCCCAAAAAAACCTTGCACTCCAACTAAAGTCACTTTCCCCAATCTCACTCCTCCGATTATATTCACCTTGCTTTTCCTTCTGCAATTTGATGAAATTGAACCAGTAGCCCTCTCTCTGTCGGCAGCAATGGCGGATCGGTATACGAAATGGATGAAGGAAGAGTTCAAAACATATGCCTACATTCTCATCTACATCGCCCTCTCCAGCGGCCAGATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131012162
ATGGCGGATCGGTATACGAAATGGATGAAGGAAGAGTTCAAAACATATGCCTACATTCTCATCTACATCGCCCTCTCCAGCGGCCAGATATTCTTTAACAAGTGGGTTTTATCATCAAAGGAAATGAATTTCCCTTATCCTCTTGGATTAACGCTGCTTCACATGATATTCTCATCGGTTCTATGTTTTGTGGTTACCAAAGTTCTCAAGATCATGAAAGTTGAGGAAGGAATGACTTTGGATATATACATATGGTCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057796064.1
MADRYTKWMKEEFKTYAYILIYIALSSGQIFFNKWVLSSKEMNFPYPLGLTLLHMIFSSVLCFVVTKVLKIMKVEEGMTLDIYIWSVVPIGGMFAMTLWLGNTAYLYISVAFAQMLKAIMPVAVFILGVLAGLEVMNTRMLLIMSVISFGVLVASYGEISISWIGVVYQMGGVVGEALRLIFMEIFVKRKGLKLNPISMMYYVSPCSAVCLLIPWIFLEMPKMDARGTWSFKQPLILILNSLCTFALNISVFLVISHTSA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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