当前解析结果
SmilChr02G001947| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001947 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001947 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001947 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 35086837 - 35088682 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008369 |
|---|---|
| GeneID | 131008369 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008369 |
| 原始查询 | SmilChr02G001947 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008369 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057791236.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057791236.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057791236.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791236.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791236.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:35086877 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B124,B22,B80,C25 |
Chr2:35086898 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C61 |
Chr2:35086906 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C16 |
Chr2:35086911 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A5,B115,B126,B70,C42 |
Chr2:35086916 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B124,B22,B80,C25 |
Chr2:35086918 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B82,C5,C58 |
Chr2:35086926 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 25 | A15,A16,A21,B10,B125,B138,B16,B20,B49,B53,B71,B8,B85,B90,B92,C12,C14,C22,C53,C57,C58,C64,C66,C7,C72 |
Chr2:35086938 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B30,B45,B67,C69,D11 |
Chr2:35086957 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A15,C86 |
Chr2:35086974 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C62 |
Chr2:35086987 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:35087042 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B22,B80,C25 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。