当前解析结果
SmilChr02G001959| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001959 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001959 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001959 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 35377477 - 35377821 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008373 |
|---|---|
| GeneID | 131008373 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008373 |
| 原始查询 | SmilChr02G001959 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008373 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057791240.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057791240.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791240.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791240.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791240.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:35377479 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,B104,C59 |
Chr2:35377488 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B58,B72,B91,C58,C59 |
Chr2:35377506 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B1,B48,B62,B77,C4 |
Chr2:35377545 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C60 |
Chr2:35377546 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B102,B121,B54,B89,C36 |
Chr2:35377546 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B102,B121,B54,B89,C36 |
Chr2:35377557 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,B110,C67 |
Chr2:35377559 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B16,B98,C2 |
Chr2:35377583 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A10,C21,C55 |
Chr2:35377590 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,B110,C67 |
Chr2:35377596 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A10,C21,C55 |
Chr2:35377630 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B52,C59 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。