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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001966`

染色体: Chr02 坐标: 35595698-35597599 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001966`
名称	SmilChr02G001966
描述	uncharacterized SmilChr02G001966
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	35595698 - 35597599 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008375`
GeneID	`131008375`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008375`
原始查询	`SmilChr02G001966`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=29.2; qcov=0.649; evalue=1.01e-47; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=27.1; qcov=0.864; evalue=2.81e-66; confidence=low
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF03372 (Exo_endo_phos); PF14529 (Exo_endo_phos_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008375

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791242.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791242.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057791242.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791242.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791242.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:35595718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C54
`Chr2:35595749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr2:35595758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B47,B50,D7
`Chr2:35595782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B21,B54,D11
`Chr2:35595809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:35595847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B32
`Chr2:35595877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B140,B3,B32,B36
`Chr2:35595878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C50
`Chr2:35595892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B140,B3,B32,B36
`Chr2:35595905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:35595930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B32,B44,B67
`Chr2:35595945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791242.1

633 aa

316

633

Exo_endo_phos

Exo_endo_phos_2

RVT_1

PF03372 Exo_endo_phos 5-220 aa PF14529 Exo_endo_phos_2 123-223 aa PF00078 RVT_1 499-619 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791242.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	5	220	4.9e-08	33.7	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family
`XP_057791242.1`	Pfam	`PF14529`	Exo_endo_phos_2	Domain	123	223	5.2e-08	33.5	Endonuclease-reverse transcriptase
`XP_057791242.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	499	619	1.6e-12	48.5	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935259.1
ATGAATATTATTGTCTGGAACGTCCGGGGGCTTACGGACGAATCTAGATGTCTTTTAAAGGAGCATTCTCGCTCTTTTAATCCCGTTATTATTGGTATTGTGGAACCTAAAGTGGATTTCAGCAAAGTTCCTGCTAATTATTGGCATTCCATCAACATGGTTGCTCGGCATCAAAATTCCCGCCATCGGATGTGCTCGAACATTTGGCTCCTGGCACATCCCTCAGTTGCCACGACTGTCGTTTGGTCCTCGGATCAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008375
ATGAATATTATTGTCTGGAACGTCCGGGGGCTTACGGACGAATCTAGATGTCTTTTAAAGGAGCATTCTCGCTCTTTTAATCCCGTTATTATTGGTATTGTGGAACCTAAAGTGGATTTCAGCAAAGTTCCTGCTAATTATTGGCATTCCATCAACATGGTTGCTCGGCATCAAAATTCCCGCCATCGGATGTGCTCGAACATTTGGCTCCTGGCACATCCCTCAGTTGCCACGACTGTCGTTTGGTCCTCGGATCAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791242.1
MNIIVWNVRGLTDESRCLLKEHSRSFNPVIIGIVEPKVDFSKVPANYWHSINMVARHQNSRHRMCSNIWLLAHPSVATTVVWSSDQTIITDCVWNSFSFRIAVVHGSNCPMDRRKLWIDLLNHTNGSTIFMGDFNAVKGAHERISTVSPNRQSCRDFCEFIEATQFIEPPTSGLKFTWSGRRFLPRHVESLIDRVLVSDSFAQNWRAINTHVLPRVTSDHSPLVFQCSGSEVRRRNSFRFLTMWTSHDNFLEVVEQSWNQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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