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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001972`

染色体: Chr02 坐标: 35694818-35697027 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001972`
名称	SmilChr02G001972
描述	GDSL esterase/lipase At5g03980-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	35694818 - 35697027 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012188`
GeneID	`131012188`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012188`
原始查询	`SmilChr02G001972`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase At5g03980-like
产物	GDSL esterase/lipase At5g03980-like
Arabidopsis	`AT1G28590` (AT1G28590) GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839759] identity=41.3; qcov=0.997; evalue=2.12e-90; confidence=medium
Rice	`Os11g0521000` (OsGELP111) - identity=50.7; qcov=0.918; evalue=1.74e-118; confidence=high
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012188

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057796081.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057796081.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796081.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796081.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796081.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:35695263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B82,C5,C58
`Chr2:35695305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B31,C78
`Chr2:35695357`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A19,B11,B36,B43,B54,B59,B65,B66,B75,C63
`Chr2:35695362`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A19,B11,B43,B54,B59,B65,B66,B75,C63
`Chr2:35695979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B40,C36
`Chr2:35696030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B68,C10,C71
`Chr2:35696064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:35696082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B13,B29,B97,C52
`Chr2:35696263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr2:35696368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B105
`Chr2:35696440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B13,B97,C52
`Chr2:35696450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B69,C74,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796081.1

367 aa

184

367

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 36-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796081.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	36	354	1.9e-30	107.3	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940098.1
AAATAAAATCTAGCGTTAATGAGCCTCTCAACTAATTTTTAAAAAATAACCCCTTGAAAAAATAAATGTGCCAACAACTGCTCGCAATCGCCATCGCTTTATCAAAATGATTACTCCAAATTATTAGAACAGTGTTGAACCTATACTTATAGACTTATAGTAATACTTTGAACATTTAATGTGAGATAAATATCGCATTATCCTAATCAATGAAACACTCCTGCAACTATAAATATAGCTCACTACATCATTTCTTATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012188
ATGGCTATTTCCTCGTCTCTCGAGAAACTTGTCTTAGCATTTATGCTTGTCCAAATTTCCTCTCTTTCACATGCCCATCTTCTAAAGATGTGCAAGATAGACCAAATCTATAACATCGGAGATTCCATTTCCGACACAGGAAATTTGGTCCGAGAAGTCGGCCTCGCCACCTTCTGCGCGAGGCCGCCTTACGGCGAATCGTATTTCAAGAAACCGTCGGGCCGATGCTCCAACGGCCTTCTTATGATTGATTTCATTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796081.1
MAISSSLEKLVLAFMLVQISSLSHAHLLKMCKIDQIYNIGDSISDTGNLVREVGLATFCARPPYGESYFKKPSGRCSNGLLMIDFIALDAGVPFLPPYRNSGADFRHGVNFAVAGSTALPWYELAAENVSSSVTNSSLSVQLDWMAAHFNSTCPNRTDCTKKVENALFMFGTIGGNDYNYALFEGKPLEELRSMVPQVVNTIMLGVKKVISYGATRVVVPGNLPIGCLPVYKTQFLTNVSASYDEKQCLKQLNDFAKYHN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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