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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001980`

染色体: Chr02 坐标: 35738340-35746842 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001980`
名称	SmilChr02G001980
描述	flowering time control protein FPA
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	35738340 - 35746842 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012194`
GeneID	`131012194`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012194`
原始查询	`SmilChr02G001980`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	flowering time control protein FPA
产物	flowering time control protein FPA
Arabidopsis	`AT4G12640` (AT4G12640) RNA recognition motif (RRM)-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826877] identity=44.2; qcov=0.893; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os09g0298700` (OsRRM) - identity=43.7; qcov=0.701; evalue=1.88e-130; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF07744 (SPOC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012194

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796087.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057796087.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057796087.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796087.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796087.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:35738639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr2:35738973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C1
`Chr2:35739016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B105
`Chr2:35739111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,C40,C46,C7
`Chr2:35739342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B30,C37
`Chr2:35740490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B77
`Chr2:35740568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr2:35740611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr2:35740690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B40,B46,C45
`Chr2:35740776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B22,B46,B80,C25
`Chr2:35740881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C45
`Chr2:35740908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796087.1

901 aa

450

901

RRM_1

SPOC

PF00076 RRM_1 36-100 aa PF00076 RRM_1 177-230 aa PF07744 SPOC 477-596 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796087.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	36	100	5e-22	78.3	RNA recognition motif
`XP_057796087.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	177	230	5e-22	78.3	RNA recognition motif
`XP_057796087.1`	Pfam	`PF07744`	SPOC	Domain	477	596	5.7e-24	85.5	SPOC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940104.1
GGAAAGAGGAAAACCCTAAAATTATGTTGTAGTACAAAATTTGGGCGCAAAGTAAATTTAGCGCTAGTAATTTTGCGACTGCTCATCTATTAATCTGCTACTGTTGCGCTGCACAGAGCTTATTTGCGCGTGGCCCACGCCATCTTCGCCTCTTTCGCACATATTCAGTGAAATTCTTCGCCTAAAACCTAACACACCCAAACCCCTCTCTCTCTCTCATCCAGCCCTAATTTTCGTCATTTTAGCGTGATCATTGATAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012194
ATGAGCATCAGAGAAGGAAGAGGCAGACCTCGTGGGGATTACCCTTCAAGATCAGAAGATAGATCCTACCGTGGTCGGGGGAGTAATCCGCCACCATCAAGGCATCTCTGGGTCGGAAATCTTCCTCACAACTTAACTGAAAGTGATGTGGTCCATCATTTTCTACACTTTGGAGAGCTTGAAAGCATTGCATTTCAACCAGGTCGGAGCTATGCTTTTATTAATTATAGAAATGAAGATGATGCCTATGCTGCATTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796087.1
MSIREGRGRPRGDYPSRSEDRSYRGRGSNPPPSRHLWVGNLPHNLTESDVVHHFLHFGELESIAFQPGRSYAFINYRNEDDAYAAFKELQGFDIEGNPLRIEYAKAEKSLAPPRDADYSERRDNPHSRGRGSPFSSRDSRMRYSSPELSHQSKSKMSDKNAEPSEVLWIGFPAQLKVDEYVLRKAFSPFGDIEKITAFPGRTYAFVRFRDVMAACEAKETLQGKLFGNPRVHICFAKNDMGPSNKERSSNAPPSPHIGKY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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