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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001981`

染色体: Chr02 坐标: 35748952-35750905 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001981`
名称	SmilChr02G001981
描述	uncharacterized SmilChr02G001981
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	35748952 - 35750905 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008379`
GeneID	`131008379`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008379`
原始查询	`SmilChr02G001981`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=23.1; qcov=0.853; evalue=6.97e-24; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=27.2; qcov=0.839; evalue=4.62e-32; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008379

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791245.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791245.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791245.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791245.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791245.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:35748967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,A9,B99,C27,C44
`Chr2:35748969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C13,C72
`Chr2:35748969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C72
`Chr2:35748994`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	40	B101,B105,B106,B107,B111,B112,B119,B129,B131,B134,B17,B28,B32,B42,B43,B55,B58,B76,B91,B93,C16,C18,C19,C3,C31,C34,C4,C40,C43,C50,C55,C56,C65,C70,C72,C74,C87,D2,D7,D9
`Chr2:35748999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:35749013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,C47,D3
`Chr2:35749020`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B4,B99,C44
`Chr2:35749020`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B4,B99,C44
`Chr2:35749021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B48,B79,B89,C30
`Chr2:35749039`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B104,C74
`Chr2:35749039`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B104,C74
`Chr2:35749049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,B99,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791245.1

416 aa

208

416

Transposase_mut

MULE

SWIM

PF00872 Transposase_mut 28-133 aa PF10551 MULE 30-85 aa PF04434 SWIM 234-263 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791245.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	28	133	7.5e-07	29.1	Transposase, Mutator family
`XP_057791245.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	30	85	4.8e-12	46.8	MULE transposase domain
`XP_057791245.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	234	263	9.9e-09	35.3	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935262.1
ATGGTTAGTGAAATGCAGCGACTATTGTCTAATCCACAGACCGTATATGATATTGAGACTGCCCCTGATGTTGGGCTTGGCCCAATTGAAAACGACGAGTCATGGACATGGTTTTTCCATCGATTGCGTGTTTGTTTTGACCAGCCTGATGATTTGTTGATTGTGTCTGATCAACATAAACGCATTAAAAATGCTGTGGAGTTAATGTATCCGAATGCGGCCCATGGATTTTGTTATTACCATATACAGAAAAATCTTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008379
ATGGTTAGTGAAATGCAGCGACTATTGTCTAATCCACAGACCGTATATGATATTGAGACTGCCCCTGATGTTGGGCTTGGCCCAATTGAAAACGACGAGTCATGGACATGGTTTTTCCATCGATTGCGTGTTTGTTTTGACCAGCCTGATGATTTGTTGATTGTGTCTGATCAACATAAACGCATTAAAAATGCTGTGGAGTTAATGTATCCGAATGCGGCCCATGGATTTTGTTATTACCATATACAGAAAAATCTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791245.1
MVSEMQRLLSNPQTVYDIETAPDVGLGPIENDESWTWFFHRLRVCFDQPDDLLIVSDQHKRIKNAVELMYPNAAHGFCYYHIQKNLARYGQHVAALFKATAYTYRSEEFERNFAALHIMKSAAHKQLLTVGEHRWARLKCCVPRTSFMTSNAAESLNSRLLWARRLPVCSLLESFRTIVEKWFDKRRSTAAARSHELTEVVSSKVHVAVEQGHRLVVRGTTTHMFIVEEENTFFVVDLENRTCECREFELDQIPCRHACA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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