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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001988`

染色体: Chr02 坐标: 35892180-35895619 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001988`
名称	SmilChr02G001988
描述	ras-related protein RABB1c-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	35892180 - 35895619 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012200`
GeneID	`131012200`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012200`
原始查询	`SmilChr02G001988`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ras-related protein RABB1c-like
产物	ras-related protein RABB1c-like
Arabidopsis	`AT4G17170` (RABB1C) RAB GTPase homolog B1C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827428] identity=91; qcov=0.995; evalue=1.97e-145; confidence=high
Rice	`Os02g0586400` (OsRab2A2) - identity=92.1; qcov=0.9; evalue=4.37e-133; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005794 (Golgi apparatus)
KEGG	-
Pfam	PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF01926 (MMR_HSR1); PF08477 (Roc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012200

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057796089.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057796089.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057796089.1`
4	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057796089.1`
5	Endosome	内体	1.00000	`XP_057796089.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:35894349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796089.1

211 aa

106

211

Arf

Roc

Ras

MMR_HSR1

PF00025 Arf 7-157 aa PF08477 Roc 8-122 aa PF00071 Ras 8-168 aa PF01926 MMR_HSR1 10-115 aa

XP_057796090.1

211 aa

106

211

Arf

Roc

Ras

MMR_HSR1

PF00025 Arf 7-157 aa PF08477 Roc 8-122 aa PF00071 Ras 8-168 aa PF01926 MMR_HSR1 10-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796089.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	7	157	1.6e-12	48.0	ADP-ribosylation factor family
`XP_057796089.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	8	122	3.2e-33	115.2	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057796089.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	8	168	4e-64	215.8	Ras family
`XP_057796089.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	10	115	4.7e-05	24.2	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057796090.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	7	157	1.6e-12	48.0	ADP-ribosylation factor family
`XP_057796090.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	8	122	3.2e-33	115.2	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057796090.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	8	168	4e-64	215.8	Ras family
`XP_057796090.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	10	115	4.7e-05	24.2	50S ribosome-binding GTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940107.1
TTTTTTTTTTGGACCCAATTCTTTCTTTTACAGTATTTTAAAATTAATTAAGGACATTTCTGTTACTTAGCACAGAAGAATTTCTCCATGTTAAGCAACATCGAAACCTCATAAAAACATTTTTGGAATCTTCCCATGTTCAAACAAATCAAGATTCAAGAACTCTTTTATCTGTTTTCTCTGGATAAGAATTCCCACCTCATTTCGTATCGAATTCATCATTATTTGATTGGCTTTCATTTGGACAAAAACACTTCGGT...

XM_057940106.1
TTTTTTTTTTGGACCCAATTCTTTCTTTTACAGTATTTTAAAATTAATTAAGGACATTTCTGTTACTTAGCACAGAAGAATTTCTCCATGTTAAGCAACATCGAAACCTCATAAAAACATTTTTGGAATCTTCCCATGTTCAAACAAATCAAGATTCAAGAACTCTTTTATCTGTTTTCTCTGGATAAGAATTCCCACCTCATTTCGTATCGAATTCATCATTATTTGATTGGCTTTCATTTGGACAAAAACACTTCGGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012200
ATGTCGTACGCTTACCTCTTCAAGTACATTATCATCGGTGATACCGGTGTTGGAAAATCATGTCTGCTTCTGCAGTTCACGGACAAGCGCTTTCAGCCAGTGCACGACTTGACCATTGGTGTCGAATTTGGAGCCAGGATGATCACAATTGAGAACAAGCCCATCAAGCTACAAATTTGGGACACGGCTGGTCAAGAATCGTTTAGGTCTATTACGAGGTCTTACTACAGAGGTGCTGCTGGAGCCCTGCTAGTTTACGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796089.1
MSYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIENKPIKLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRETFNHLASWLEDARQHASMNMTIMLIGNKCDLAHRRAVSTEEGEQFAKENGLVFMEASAKTAQNVEEAFVQTASTIYKKIQDGAFDASNESNGIKIGYGGNQGTSAGRDGAASQGGVCCS

XP_057796090.1
MSYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIENKPIKLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRETFNHLASWLEDARQHASMNMTIMLIGNKCDLAHRRAVSTEEGEQFAKENGLVFMEASAKTAQNVEEAFVQTASTIYKKIQDGAFDASNESNGIKIGYGGNQGTSAGRDGAASQGGVCCS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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