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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001999`

染色体: Chr02 坐标: 36147494-36149449 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001999`
名称	SmilChr02G001999
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	36147494 - 36149449 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012212`
GeneID	`131012212`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012212`
原始查询	`SmilChr02G001999`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=55.2; qcov=0.315; evalue=2.18e-34; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=55.9; qcov=0.78; evalue=5.92e-145; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012212

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796100.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057796100.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796100.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796100.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796100.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:36148180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr2:36148199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr2:36148201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:36148379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:36148530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B67,B98,C30,C54,D11
`Chr2:36148587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr2:36148742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B118,C11,C17
`Chr2:36148812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B124,B72,D5
`Chr2:36148817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr2:36148820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C62
`Chr2:36148822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:36148852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796100.1

454 aa

227

454

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 80-119 aa PF04827 Plant_tran 187-388 aa PF13359 DDE_Tnp_4 240-381 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796100.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	80	119	2.7e-19	69.3	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057796100.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	187	388	3e-93	311.9	Plant transposon protein
`XP_057796100.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	240	381	9.4e-09	35.8	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940117.1
GCATCCACAATGGTGGGTGCGATGGCCGGATCGAACCCGGCCTATCGCACCCACCACCATTGCCGCTCCCGGGTGCGATGGAGGGGAGGCGTGCGTTCGCACTCGACGAATGTGGGAGCGAAGGAGGGGGCGTGTAAACACGCGCCCCTTTCCGAAATTAAAAAAAAAAAAATAATAATTTTAACGGTCAAATGACCGTTGCCTTCAACGGTCTTCGGCCGATTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTCTTTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012212
ATGTCTTCATCCACCAATTCTTCCAACAATAATTCTTCCTCAAATTCTTCATCCGAAGAAGAAGTTCATGTTGATCCCGCACAACTTCCTCCTCTTCCCGATCCTACTCAAGCCCCCGATTTATTTTTTATGAGATGTGCTGTGAATTTTATGCAAGTAGCAAGTTCATATCGGTTCGATCCACCTCCACAACGCCCGGCGAAAAAGCGGACAGTGGTTCATCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796100.1
MSSSTNSSNNNSSSNSSSEEEVHVDPAQLPPLPDPTQAPDLFFMRCAVNFMQVASSYRFDPPPQRPAKKRTVVHRDREGGAERLHRDYFAVEPVYGPQFFRRRFRMSRELFLRIVNALEVDPYFQQRSDAVGRVGFSPIQKCTAAIRQLAYGNSADCCDEYLRIGETTALECLKKFCKAVVRIFGGTYLRRPTTADVQRITAMHEARHGFPGMLGSLDCMHWGWKNCPIAWHGAYTRGDQGEPTIILEAVASQDLWIWHA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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