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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002002`

染色体: Chr02 坐标: 36170598-36172024 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002002`
名称	SmilChr02G002002
描述	WRKY transcription factor 71-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	36170598 - 36172024 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012215`
GeneID	`131012215`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012215`
原始查询	`SmilChr02G002002`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WRKY transcription factor 71-like
产物	WRKY transcription factor 71-like
Arabidopsis	`AT4G18170` (WRKY28) WRKY DNA-binding protein 28 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827542] identity=66.4; qcov=0.415; evalue=1.27e-41; confidence=low
Rice	`Os05g0565900` (OsWRKY49) - identity=75.9; qcov=0.322; evalue=1.98e-40; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012215

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796102.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796102.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796102.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796102.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796102.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:36170789`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A21,A25,A6,B105,B111,B113,B127,B28,B50,B72,B74,B82,C13,C18,C24,C30,C50,C81,C84
`Chr2:36170917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr2:36170953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B111
`Chr2:36171051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A9,D1,D8
`Chr2:36171119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B14,B20,C38,C79
`Chr2:36171447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B22,B80,C25
`Chr2:36171790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B13,B57,B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796102.1

258 aa

129

258

WRKY

PF03106 WRKY 140-197 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796102.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	140	197	7.6e-26	90.8	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940119.1
CAAACCATACAGTTGTATTTATTGAACATCACTTTCATGATCATGACTCATATGACTGATCATCTCTCAATGCTTGAATATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTCCAGAGAGAGAAAGGGGAGGGGGGCAAAAGAGTATGTGAAAAAGCACAAGTCACACAATAAAAAGAAAACCCTTTAATGAGTTTCTCCTCAAAAAAGAAAATTGAAGATCGATCATCTCCCATGTCTGATGCAGACAATTACAAGATGGGATCACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012215
ATGAGTTTCTCCTCAAAAAAGAAAATTGAAGATCGATCATCTCCCATGTCTGATGCAGACAATTACAAGATGGGATCACAACAAGGGTTGCAGTTTTCCTTCTTAGCCGATCACACCTCTTTCATGTACAACCACCCGAAGCAGCAAAACCCTAGTGACACGATGAGCTTCTTTTACAACACTCCATCGCCATCACCTGCTTTTGACCCTTCTTGCTCATCATCTGAACCACCTCTTTTTGCTGTCAACAAGAATCTTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796102.1
MSFSSKKKIEDRSSPMSDADNYKMGSQQGLQFSFLADHTSFMYNHPKQQNPSDTMSFFYNTPSPSPAFDPSCSSSEPPLFAVNKNLGENPNSSEAAAVEEADSCPKHCKAGDLKPKKVKEKKAREARFAFVTKSEVDNLEDGYRWRKYGQKAVKNSPFPRSYYKCTSQKCSVKKLIERSYEDSTMVITTYLGRHNHHSPATLRGRAAVLPPPLQPQFGFHNFPENYFTSIHPNFPQLEINPQFLADQFNMDSSFLQHP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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