当前解析结果
SmilChr02G002006| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002006 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002006 |
| 描述 | glycine-rich cell wall structural protein-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 36195839 - 36196471 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008382 |
|---|---|
| GeneID | 131008382 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008382 |
| 原始查询 | SmilChr02G002006 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glycine-rich cell wall structural protein-like |
| 产物 | glycine-rich cell wall structural protein-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008382 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.60000 | XP_057791249.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057791249.1 |
| 3 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.20000 | XP_057791249.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791249.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791249.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:36195855 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A16,B33,B35 |
Chr2:36196035 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B41 |
Chr2:36196035 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr2:36196041 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C30 |
Chr2:36196078 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:36196080 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:36196127 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B60,D4 |
Chr2:36196148 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B6 |
Chr2:36196149 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr2:36196159 |
TG |
* |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr2:36196194 |
C |
CG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | C68,C87 |
Chr2:36196194 |
C |
CG |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | C68,C87 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。