当前解析结果
SmilChr02G002017| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002017 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002017 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002017 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 36328049 - 36329753 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131012240 |
|---|---|
| GeneID | 131012240 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012240 |
| 原始查询 | SmilChr02G002017 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003677 (DNA binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012240 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057796139.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057796139.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796139.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057796139.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057796139.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:36328204 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B80,C41,C61,C70 |
Chr2:36328207 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B129,B30,C37 |
Chr2:36328237 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr2:36328271 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B126 |
Chr2:36328285 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr2:36328756 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B1 |
Chr2:36328756 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr2:36328818 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | A24,B131,B132,B5,B94,D11 |
Chr2:36328843 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,A19,B68,C43 |
Chr2:36328925 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 66 | A16,A18,A23,A24,A7,B10,B101,B106,B11,B115,B118,B120,B124,B126,B131,B132,B2,B21,B23,B34,B41,B42,B43,B49,B5,B52,B59,B61,B64,B73,B8,B80,B91,B94,B95,C11,C17,C20,C22,C27,C28,C30,C35,C4,C41,C42,C44,C45,C48,C51,C55,C56,C61,C65,C69,C70,C71,C76,C78,C82,C87,C9,D11,D4,D7,D9 |
Chr2:36328936 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B80,C41,C61 |
Chr2:36329029 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C41 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。