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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002035`

染色体: Chr02 坐标: 36631646-36632296 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002035`
名称	SmilChr02G002035
描述	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	36631646 - 36632296 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008393`
GeneID	`131008393`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008393`
原始查询	`SmilChr02G002035`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
产物	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
Arabidopsis	`AT5G18960` (FRS12) FAR1-related sequence 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832014] identity=45; qcov=0.185; evalue=3.09e-07; confidence=weak
Rice	`Os03g0581100` (OS-CAD) - identity=27.6; qcov=0.889; evalue=1.77e-09; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008393

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791260.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791260.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791260.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791260.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791260.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:36631647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B29,B69,C19,C84
`Chr2:36631687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B35,C37
`Chr2:36631719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B35,C37
`Chr2:36631779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B30,B35,C37
`Chr2:36631794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,C41,C61
`Chr2:36632061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,C51,C85
`Chr2:36632114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C61
`Chr2:36632144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B30,B35,C37
`Chr2:36632149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C24,C50
`Chr2:36632264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B30,B35,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791260.1

216 aa

108

216

SWIM

PF04434 SWIM 31-47 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791260.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	31	47	0.00061	20.0	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935277.1
ATGTCGAAGATGGAGGGTAACAAGTATGTTGTCGATGACAACATTGATGGATTATTCACTGTTATTCATGATACAGTTACTGATTATTTCAGATGCACGTGCAATATGTTCACTAGGAAGGGGTTTTTATGCAGCCACATATTTTATGTGCTGAGGACTTTGAAAGTGGCCGAGATTCCCGAGAAATACATTGCTAATCGTTGGTGCAAATCATATATGTTATCTACATTTCAAGCGACAGATAAGATGACATGTCCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008393
ATGTCGAAGATGGAGGGTAACAAGTATGTTGTCGATGACAACATTGATGGATTATTCACTGTTATTCATGATACAGTTACTGATTATTTCAGATGCACGTGCAATATGTTCACTAGGAAGGGGTTTTTATGCAGCCACATATTTTATGTGCTGAGGACTTTGAAAGTGGCCGAGATTCCCGAGAAATACATTGCTAATCGTTGGTGCAAATCATATATGTTATCTACATTTCAAGCGACAGATAAGATGACATGTCCGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791260.1
MSKMEGNKYVVDDNIDGLFTVIHDTVTDYFRCTCNMFTRKGFLCSHIFYVLRTLKVAEIPEKYIANRWCKSYMLSTFQATDKMTCPTRNLPIGNDELFKVFSNCIGHVNGDEELRKQLLADFIDVENKFKNLGKHNPMANSKAAMLNEFYGATPPDVPTVLPPAISKTKGSGAGGLRKSNMEKAITLSQKPLRNCKRCNTMAHHDSRNCPTKALPK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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