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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002048`

染色体: Chr02 坐标: 36878258-36879733 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002048`
名称	SmilChr02G002048
描述	phosphatidylglycerophosphate phosphatase 1, chloroplastic/mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	36878258 - 36879733 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012236`
GeneID	`131012236`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012236`
原始查询	`SmilChr02G002048`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidylglycerophosphate phosphatase 1, chloroplastic/mitochondrial-like
产物	phosphatidylglycerophosphate phosphatase 1%2C chloroplastic/mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT3G58830` (AT3G58830) haloacid dehalogenase (HAD) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825052] identity=67.6; qcov=0.824; evalue=1.21e-104; confidence=high
Rice	`Os01g0796500` - identity=55.3; qcov=0.808; evalue=3.03e-76; confidence=high
GO	GO:0008962 (phosphatidylglycerophosphatase activity)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF09419 (PGP_phosphatase); PF13242 (Hydrolase_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012236

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057796135.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057796135.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796135.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796135.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796135.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:36878642`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C14,C76
`Chr2:36878642`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C14,C76
`Chr2:36878677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr2:36878700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B68,C32,C45,C68
`Chr2:36878824`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C10,C71
`Chr2:36878824`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C10,C71
`Chr2:36878832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C80
`Chr2:36878853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B56,B64,B96
`Chr2:36879248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C80
`Chr2:36879526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B35,B48,C29,C49,C50
`Chr2:36879526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B48,C29,C49,C50
`Chr2:36879569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796135.1

255 aa

128

255

PGP_phosphatase

Hydrolase_like

PF09419 PGP_phosphatase 17-171 aa PF13242 Hydrolase_like 133-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796135.1`	Pfam	`PF09419`	PGP_phosphatase	Family	17	171	3.8e-43	147.7	Mitochondrial PGP phosphatase
`XP_057796135.1`	Pfam	`PF13242`	Hydrolase_like	Domain	133	172	1.5e-06	28.7	HAD-hyrolase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940152.1
AACAAAAATTGTAAGACGTAGGATCTCATTTGGATTTAGTATTGGAACAAAATATACTCCGCATATTGATATTTTGATTTTTAAACATCTCTTCTCCAACTTACCCCACCAACAAAGTTCTCGATTCAGAATCCCTAAATCTTTTCGCACAAACTGTAATTTTCATAAGAGTAACAGAAGCAGAATCCTCGCACCAGAAAATATTCATAGTAGGGCAGAAATGAAAAAGGCCAGAGCTTTTCCAGTAATTCAACCTATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012236
ATGTGGTGGGCTGACCTGAAAGCTGCTTTGGGGCAGAGAATCAACCTTGAAGGCATCGCTTGCGCCGTGGGAATTGTGTCGAAAGAGCAGCATTTGGCGATCCCGCATGTCAGTGTGCCTGACATAAGGTATATCGATTGGGCTGAGCTGAAGAAAAGGGGATTTAAAGGCGTCGTCTTTGATAAGGATAACACCATTACTGTTCCTTACTCTTTGAGCTTGTGGCCACCCCTGGGCTCGTCGATAGACCAGTGTAGATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796135.1
MWWADLKAALGQRINLEGIACAVGIVSKEQHLAIPHVSVPDIRYIDWAELKKRGFKGVVFDKDNTITVPYSLSLWPPLGSSIDQCRSLFGDNVAVFSNSAGLSEYDPDGEKARALEDSIGIKVIRHRTKKPAGSAEEIEELFGCESSSLVMVGDRPFTDIVYGNRNGFFTILSGSLSLAEEPLIVRQVRLLEVALVKRWSESGVKMTTQSCSGFYGVCKRYTTLIVIYEYGFQNDIVFVGNRIFEKIRTNSSILD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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