当前解析结果
SmilChr02G002050| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002050 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002050 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002050 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 36918327 - 36927870 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131012234 |
|---|---|
| GeneID | 131012234 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012234 |
| 原始查询 | SmilChr02G002050 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012234 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057796133.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057796133.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057796133.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057796133.1 |
| 5 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057796133.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:36918612 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B16,C20 |
Chr2:36918616 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A19 |
Chr2:36918617 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 16 | A4,B102,B103,B129,B134,B2,B27,B65,B77,C16,C18,C27,C38,C43,C70,D2 |
Chr2:36918621 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,B119,B25,C5,C68 |
Chr2:36918624 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,A6,B109,B136,B7 |
Chr2:36918638 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B30,B77,C32,C76 |
Chr2:36918659 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 12 | A11,A18,A22,B117,B123,B137,B31,B85,B92,B93,C1,C58 |
Chr2:36918664 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr2:36918674 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 21 | A4,B102,B129,B130,B134,B20,B27,B37,B65,B69,B77,C13,C16,C18,C27,C38,C43,C56,C70,C9,D2 |
Chr2:36918677 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,C14,C44,C81 |
Chr2:36918686 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B132,B135,B58,B97,C15 |
Chr2:36918690 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B65,B75,C11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。