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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr02G002050

染色体: Chr02 坐标: 36918327-36927870 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr02G002050
名称SmilChr02G002050
描述uncharacterized SmilChr02G002050
染色体 / SeqIDChr02 / NC_080388.1
坐标与链方向36918327 - 36927870 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131012234
GeneID131012234
locus_tag-
NCBI NameLOC131012234
原始查询SmilChr02G002050

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述confidence=no_hit
产物confidence=no_hit
Arabidopsis-
-
Rice-
-
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131012234

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytoplasm 细胞质 1.00000 XP_057796133.1
2 Nucleus 细胞核 0.80000 XP_057796133.1
3 Nucleoplasm 核质 0.80000 XP_057796133.1
4 Cytosol 细胞质基质 0.60000 XP_057796133.1
5 Secreted 分泌到胞外 0.20000 XP_057796133.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr2:36918612 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B16,C20
Chr2:36918616 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 A19
Chr2:36918617 C T EMS_canonical_SNV stop_gained 16 A4,B102,B103,B129,B134,B2,B27,B65,B77,C16,C18,C27,C38,C43,C70,D2
Chr2:36918621 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A18,B119,B25,C5,C68
Chr2:36918624 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A21,A6,B109,B136,B7
Chr2:36918638 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B30,B77,C32,C76
Chr2:36918659 C T EMS_canonical_SNV stop_gained 12 A11,A18,A22,B117,B123,B137,B31,B85,B92,B93,C1,C58
Chr2:36918664 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C46
Chr2:36918674 C T EMS_canonical_SNV stop_gained 21 A4,B102,B129,B130,B134,B20,B27,B37,B65,B69,B77,C13,C16,C18,C27,C38,C43,C56,C70,C9,D2
Chr2:36918677 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 A7,C14,C44,C81
Chr2:36918686 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B132,B135,B58,B97,C15
Chr2:36918690 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B65,B75,C11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057940150.1
CCCTTGACCTAACAAGAACGATTACATGTTGTGGTCTTAAGTGCCACTACCAATAAGGAATGTTTCAAAAGAGTTACCAACCAATAACCCCACAGATTGTTGTAATAACATAGAAAGCCAGGAGTATCTATGAGATAGAAATAGGACCACTGAATTAGGATTTACAAAACTTGAGAATCACATAGGACGTTCGAAGGAAGAGTATGGACCTTAGGCATTGCTTAAGCCTCTTTTACATTTTTATTTATAGTATCTCATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131012234
ATGGAACCACCCCAACCACCCCCAAGATTCCCCGCACTTAGGGATATGATCGATCAGATGAGGCACACTCAGGACTTGGAGGATAGGCTCCGACGGTTTTGGCTGTGTCAATGGGATCCGAACGAGCCCTTTGGGGCATTTTTGGGGCGATTCGTGCACGCTTGGCAGTTTGTGCGGACGATCGGCGTCACAGACTACTACGAGGCCGGTCAGCAACTGATCCGACATTTGCTTTTCGGCTGGAGAGACTGGGCGGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057796133.1
MEPPQPPPRFPALRDMIDQMRHTQDLEDRLRRFWLCQWDPNEPFGAFLGRFVHAWQFVRTIGVTDYYEAGQQLIRHLLFGWRDWADEQLDDTSTRQLFTSRPLGNFVLFSMRIFNRWASHGLTAPLPAVAPVEMPPPQYHHYPLNQPANAAAPFPPYPMNGDEYEDSPPRGPVVDALAPPLVPPPQEPADEPEVPRRYRIRLDDYGQPFALPNEDMMGPEIMLEDPPAPPALPAPADNDIPIIEVEDEEDPEEDPEEDPA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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