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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002055`

染色体: Chr02 坐标: 36945699-36946691 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002055`
名称	SmilChr02G002055
描述	protodermal factor 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	36945699 - 36946691 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012239`
GeneID	`131012239`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012239`
原始查询	`SmilChr02G002055`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protodermal factor 1-like
产物	protodermal factor 1-like
Arabidopsis	`AT2G42840` (PDF1) protodermal factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818884] identity=62.4; qcov=0.529; evalue=4.01e-41; confidence=medium
Rice	`Os01g0726700` - identity=47.6; qcov=0.612; evalue=3.94e-33; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF27764 (PDF1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012239

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057796138.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796138.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796138.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796138.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796138.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:36945920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:36946021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B139,C82
`Chr2:36946170`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C22,C47
`Chr2:36946170`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C22,C47
`Chr2:36946300`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B66
`Chr2:36946300`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B66
`Chr2:36946311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B22,B80,C25
`Chr2:36946342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr2:36946468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796138.1

206 aa

103

206

PDF1_C

PF27764 PDF1_C 99-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796138.1`	Pfam	`PF27764`	PDF1_C	Domain	99	203	1.1e-50	171.5	Protodermal factor 1 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940155.1
GTGAGGTAGAGAGATGGAGATTTAAATGCAGCAGCAAGGCACACACACACACTCATGCTCTTGGTCTTTATATAGGGCGCGCTCCTTCCCCTACATCCCTCATCTTCTCTACTTTACCACAAGATGAGAAGCATAGTATTGCTTGTGTGGGCTGCGTCCCTCGTGTCCGCGCTCGAGTTTCATGATCAGAAGAACTTCTTCTATCCAGATCCAAACGCATCCACACCTCCCACAGTTTCATACTCTCCTCCAGCAACTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012239
ATGAGAAGCATAGTATTGCTTGTGTGGGCTGCGTCCCTCGTGTCCGCGCTCGAGTTTCATGATCAGAAGAACTTCTTCTATCCAGATCCAAACGCATCCACACCTCCCACAGTTTCATACTCTCCTCCAGCAACTCCAGCAACTCCAAATCCGACAACTTCCCAAGGAGGGACCGGCACCCCACCGGCTAGCTGTGGAGCTCCCCCGAGTGGAGGCCACCACACCTCCGATCCATCGCCACCAGCAGGCCAAGGATACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796138.1
MRSIVLLVWAASLVSALEFHDQKNFFYPDPNASTPPTVSYSPPATPATPNPTTSQGGTGTPPASCGAPPSGGHHTSDPSPPAGQGYNPNPPSTVSPPYTCTYWKNHPSLIWGMLGWSGSVGKAFGVSSVPGLGPNINLLQALSNTRTDGYGEICRQGTAALLNSMADAKFPYTTAQVRNSFAAALSSNDAAAAQARLFKRANEPSH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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