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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002069`

染色体: Chr02 坐标: 37243238-37243798 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002069`
名称	SmilChr02G002069
描述	glutathione S-transferase T3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	37243238 - 37243798 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008403`
GeneID	`131008403`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008403`
原始查询	`SmilChr02G002069`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutathione S-transferase T3-like
产物	glutathione S-transferase T3-like
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=36.7; qcov=0.688; evalue=1.51e-18; confidence=low
Rice	`Os06g0521000` - identity=32.5; qcov=0.909; evalue=2.54e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008403

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791268.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791268.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791268.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791268.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791268.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:37243247`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	29	A23,A3,B10,B101,B125,B20,B24,B29,B36,B5,B52,B53,B62,B67,B73,B80,B81,C11,C12,C20,C21,C29,C33,C51,C69,C7,C76,D11,D3
`Chr2:37243279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B98
`Chr2:37243279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr2:37243281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,C9,D9
`Chr2:37243283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B67,B96,C42,D9
`Chr2:37243299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A18,B10,B114,B119,B123,B133,B134,B26,B27,B34,B4,B70,B75,C21,C3,C35,C38,C57,C63,D8
`Chr2:37243323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	B131,B46,B49,B61,B8,B83,B9,C10,C2,C44,C64,C66,C72,C74,C77,D7
`Chr2:37243331`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D9
`Chr2:37243331`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D9
`Chr2:37243332`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D9
`Chr2:37243332`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D9
`Chr2:37243339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935285.1
ATGTCTTCGAATTTTCCCCAACAATTTCCATTCAACTCTCCTGGTGGTTTAAATTTTTCTCAACAATTTCCATTCAACTCTCCTACAGGATCAAGCTTTCATCCACAATTTTCATCCAATTTTCCTTCTACCTATTTCATGCCTCCACCAAATCAATTTCAGGAAAATAACTCACAATTTCCTCAGCATTCTTCACAAATTCCAATTGTTGATGATGACGTCGAGGAAGTTGGAAAATCCACTGCAAAAACCAAGGAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008403
ATGTCTTCGAATTTTCCCCAACAATTTCCATTCAACTCTCCTGGTGGTTTAAATTTTTCTCAACAATTTCCATTCAACTCTCCTACAGGATCAAGCTTTCATCCACAATTTTCATCCAATTTTCCTTCTACCTATTTCATGCCTCCACCAAATCAATTTCAGGAAAATAACTCACAATTTCCTCAGCATTCTTCACAAATTCCAATTGTTGATGATGACGTCGAGGAAGTTGGAAAATCCACTGCAAAAACCAAGGAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791268.1
MSSNFPQQFPFNSPGGLNFSQQFPFNSPTGSSFHPQFSSNFPSTYFMPPPNQFQENNSQFPQHSSQIPIVDDDVEEVGKSTAKTKETKAAWSPDEDILLIKDWYNTSTDSIIGNQQKRKDFWEKITAYYNEWKPEGTAARSLSQVKNHYYRLNPDLNKWAGIYNNFWSNRVSGQGDDDVLEAAKRA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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