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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002073`

染色体: Chr02 坐标: 37325956-37330395 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002073`
名称	SmilChr02G002073
描述	heat stress transcription factor A-4b-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	37325956 - 37330395 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012268`
GeneID	`131012268`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012268`
原始查询	`SmilChr02G002073`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heat stress transcription factor A-4b-like
产物	heat stress transcription factor A-4b-like
Arabidopsis	`AT4G18880` (HSF A4A) heat shock transcription factor A4A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827622] identity=41.9; qcov=1.04; evalue=1.62e-83; confidence=medium
Rice	`Os01g0749300` (HSFA4A) - identity=44; qcov=1.03; evalue=1.85e-91; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF00447 (HSF_DNA-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012268

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796165.1`
2	PML body	PML body	0.20000	`XP_057796165.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057796165.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796165.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796165.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:37326764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr2:37327283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D3
`Chr2:37327283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:37327331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B131,C71
`Chr2:37327685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B131,C71,D7
`Chr2:37327691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:37327849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:37327918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C53
`Chr2:37327955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B139,C82
`Chr2:37328000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B82,B83,B94,C10,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796165.1

388 aa

194

388

HSF_DNA-bind

PF00447 HSF_DNA-bind 14-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796165.1`	Pfam	`PF00447`	HSF_DNA-bind	Domain	14	103	3.6e-30	105.2	HSF-type DNA-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009097254.1
AACGAAGTAACGAGTCTCGTCAATAAAGACAAAGCAACGACTGCGTCTCTGTTTACCGTTTACCCTCCAATGCTGAATTCAACGCTCTGTTTTTTCAAACAAACAAAAATGCTACAAGAATCTTTAGAAAATTCAACTCAAACCCCAAGTAATGATCACTTTTCCCTTGTAAAAGAAACAATCTTAAACAATTATTACAACTCCCTTTTCCCCAATTTCGAACAATTTTTTTTCTGCCGGACTGTTGAAAGTCAAAGGCT...

XR_009097253.1
CGTCTCTGTTTACCGTTTACCCTCCAATGCTGAATTCAACGCTCTGTTTTTTCAAACAAACAAAAATGCTACAAGAATCTTTAGAAAATTCAACTCAAACCCCAAGTAATGATCACTTTTCCCTTGTAAAAGAAACAATCTTAAACAATTATTACAACTCCCTTTTCCCCAATTTCGAACAATTTTTTTTCTGCCGGACTGTTGAAAGTCAAAGGCTCGAACACCGACGATTTTATGCTTCATTCTGTTTTGGTTTTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012268
ATGGATGGATCAAACGGCAGTTCTTCGTCGCCGGCGCCATTTCTGGTGAAGACGTACGAGATGGTGGATGATCCAATGACAAATTCTGTTGTTTCTTGGAGTCACACAGGCCAAAGTTTTGTCGTTTGGAATCCACCTGAGTTTGCTAGAGATTTGTTGCCAAAGTATTTCAAGCACAATAACTTCTCCAGCTTCATCAGGCAATTGAATACATATGGTTTTAGAAAGACTGATCCTGACCAATGGGAGTTTGCAAATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796165.1
MDGSNGSSSSPAPFLVKTYEMVDDPMTNSVVSWSHTGQSFVVWNPPEFARDLLPKYFKHNNFSSFIRQLNTYGFRKTDPDQWEFANEEFIRGQQHLLKNIYRRKPIHSHSGQGNVAPLSDSEREHFEKEIQQLKGEKVLLQSEVERRRHESQGYEHQLSCLRQTLQNIDHRQRQLMISLAQLLEKPSTMEHSEFQRKKRRSVALNFLQGEGLQGEDRGMSLLGNSGALSLPLMNLEQVEKLDSSLNFWEKFIHGVQAPAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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