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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002096`

染色体: Chr02 坐标: 37613580-37615449 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002096`
名称	SmilChr02G002096
描述	uncharacterized SmilChr02G002096
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	37613580 - 37615449 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008409`
GeneID	`131008409`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008409`
原始查询	`SmilChr02G002096`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0629600; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0629600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0629600` - identity=24.1; qcov=0.859; evalue=5.42e-09; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008409

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791274.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057791274.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057791274.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791274.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791274.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:37613625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A1,A13,B117,B21,B33,B46,B52,B59,C27,C55,C60,C83
`Chr2:37613644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B122,B140,C8,D3
`Chr2:37613652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B59,C15
`Chr2:37613660`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	27	A13,A16,A19,A23,A7,A8,B100,B115,B12,B124,B127,B131,B23,B4,B46,B47,B59,B72,B73,C11,C15,C17,C32,C43,C48,C65,C76
`Chr2:37615008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B95,C14
`Chr2:37615085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr2:37615114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C48
`Chr2:37615120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	39	A10,A19,B102,B109,B115,B118,B120,B123,B130,B131,B138,B17,B27,B40,B47,B5,B50,B63,B64,B65,B68,B70,B74,B79,B86,B95,C11,C2,C46,C47,C60,C61,C65,C67,C73,C75,D4,D5,D9
`Chr2:37615121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B4,C18,C43
`Chr2:37615138`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C44
`Chr2:37615138`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C44
`Chr2:37615183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	74	A10,A13,A15,A19,A20,A21,A25,B104,B105,B112,B113,B114,B115,B118,B119,B121,B123,B128,B135,B20,B24,B36,B38,B40,B43,B47,B51,B53,B6,B60,B61,B64,B71,B78,B79,B81,B84,B86,B87,B95,C1,C14,C19,C2,C23,C26,C29,C37,C39,C4,C40,C41,C46,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C61,C65,C66,C67,C68,C7,C71,C72,C74,C75,C77,C8,C81,C84,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791274.1

198 aa

198

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 58-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791274.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	58	198	5.5e-16	59.5	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935291.1
ATGGTGTTCGATCCAGCCATGCAGTTGGTTGGAGCAGTGTGTGGGCGAGGGACTGTCGCGACGACAGCATCTGCCTTTGCAGAATGCTGCTGTGCTGTTGCGTACATATGTGGTGTGGGGCTGGGCTTACCGGTCCAAAGTTTTTGGAATGGAAACGCAATCCTGGGATATGTCCTAGACGCGAAGGAGTATAAGTTTGTGCTTACTACTCCAGCTCCTGCGAACCCAACTGCTCGATCTTCCGATGAGCAAAGGGAGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008409
ATGGTGTTCGATCCAGCCATGCAGTTGGTTGGAGCAGTGTGTGGGCGAGGGACTGTCGCGACGACAGCATCTGCCTTTGCAGAATGCTGCTGTGCTGTTGCGTACATATGTGGTGTGGGGCTGGGCTTACCGGTCCAAAGTTTTTGGAATGGAAACGCAATCCTGGGATATGTCCTAGACGCGAAGGAGTATAAGTTTGTGCTTACTACTCCAGCTCCTGCGAACCCAACTGCTCGATCTTCCGATGAGCAAAGGGAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791274.1
MVFDPAMQLVGAVCGRGTVATTASAFAECCCAVAYICGVGLGLPVQSFWNGNAILGYVLDAKEYKFVLTTPAPANPTARSSDEQREVHKRWHSANNMAKAYIMTTMSSALQLQHQSMETAASIMKNLEDLFGESDRSVRFEIMRKLMSSKMLEGSSVREHVLGMIHHFNELDLLGGGIANDTKVDMVIYTLPKFYENF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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