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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002098`

染色体: Chr02 坐标: 37657053-37658576 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002098`
名称	SmilChr02G002098
描述	uncharacterized SmilChr02G002098
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	37657053 - 37658576 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012293`
GeneID	`131012293`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012293`
原始查询	`SmilChr02G002098`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0731800; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0731800; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G01070` (AT5G01070) RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831898] identity=39.3; qcov=0.839; evalue=2.29e-20; confidence=low
Rice	`Os01g0731800` - identity=38.7; qcov=0.851; evalue=7.95e-27; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF12906 (RINGv)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012293

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057796200.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057796200.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057796200.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057796200.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057796200.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:37657271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:37657275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B14
`Chr2:37657310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:37657349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,C56,D9
`Chr2:37657380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B1
`Chr2:37657424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B95,C14
`Chr2:37657891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B20
`Chr2:37657969`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	38	A5,B123,B128,B129,B131,B21,B24,B27,B36,B38,B39,B40,B44,B47,B51,B62,B7,B85,B89,B91,C11,C25,C31,C37,C39,C44,C52,C54,C58,C62,C65,C67,C69,C73,C78,C80,C83,D5
`Chr2:37658057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796200.1

161 aa

161

RINGv

PF12906 RINGv 39-89 aa

XP_057796201.1

161 aa

161

RINGv

PF12906 RINGv 39-89 aa

XP_057796202.1

161 aa

161

RINGv

PF12906 RINGv 39-89 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796200.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	39	89	8.1e-10	39.4	RING-variant domain
`XP_057796201.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	39	89	8.1e-10	39.4	RING-variant domain
`XP_057796202.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	39	89	8.1e-10	39.4	RING-variant domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

9 records

下载 cDNA FASTA

XR_009097266.1
AAAGATTTCTTGTCATAGTGTCGTAGTTGTACCTTTCTTCCAATCAAAGAATTCTGACTATGTTTTTGTTTGGTTGTTGCAGACAAATTCAAGGCCTCAAATTTTACACAAATATCAAATCAAGTCAACCTGCTTTTTCAGAGATCGAAAACTGGTACATCACTTCATCTATTGCCCACGTGTGTGCAAACGTCGGGAACTTGCCGTCGCTATCTTTCAGGTTGGATTTCTGAAACTGAAATCTCATTTTTGAATTTAAT...

XR_009097264.1
AAAGATTTCTTGTCATAGTGTCGTAGTTGTACCTTTCTTCCAATCAAAGAATTCTGACTATGTTTTTGTTTGGTTGTTGCAGACAAATTCAAGGCCTCAAATTTTACACAAATATCAAATCAAGTCAACCTGCTTTTTCAGAGGTCTACTTAAAACAATTTCACCTGTTCATTTACGCCAAATTTCCTCTAATTTTCCGATTTTTTGCAGATCGAAAACTGGTACATCACTTCATCTATTGCCCACGTGTGTGCAAACGT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131012293
ATGGAGGAGCATGGAGGAGAAGAAAACAAAATATGTGAGGAGGGAGGAAAGAAGTGGAACGACGACGTTTTGGTGGCGATAAAGGAGGATAGTGGTAGCAAGAGAGAGAAATTGTGCAGAATTTGCCATTTCAGCGATGATGAATCTTCAGGTGAGTCTCAACTTATGACGCTAGGCTGTGATTGCAGAGGAGAGCTCGGTGTTTCGCATCCTAACTGCGCCGCCCTCTGGTTTTCGCGCAAGGGAAACGGAGTATGTGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057796200.1
MEEHGGEENKICEEGGKKWNDDVLVAIKEDSGSKREKLCRICHFSDDESSGESQLMTLGCDCRGELGVSHPNCAALWFSRKGNGVCEICGKSAKNINLSNSEAVENAMLRMEMNEIRMVIEAIDSSNESSRRCKMSFCNFLLACLLLAFLLPWFFRGIDML

XP_057796201.1
MEEHGGEENKICEEGGKKWNDDVLVAIKEDSGSKREKLCRICHFSDDESSGESQLMTLGCDCRGELGVSHPNCAALWFSRKGNGVCEICGKSAKNINLSNSEAVENAMLRMEMNEIRMVIEAIDSSNESSRRCKMSFCNFLLACLLLAFLLPWFFRGIDML

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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