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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002100`

染色体: Chr02 坐标: 37670534-37674674 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002100`
名称	SmilChr02G002100
描述	shaggy-related protein kinase zeta
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	37670534 - 37674674 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012288`
GeneID	`131012288`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012288`
原始查询	`SmilChr02G002100`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	shaggy-related protein kinase zeta
产物	shaggy-related protein kinase zeta
Arabidopsis	`AT2G30980` (SKdZeta) SHAGGY-related protein kinase dZeta [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817649] identity=88.6; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0207500` (GSK2) - identity=88; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012288

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796192.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057796192.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057796193.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057796195.1`
5	Cell projection	细胞突起	0.20000	`XP_057796195.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:37670919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,D11
`Chr2:37671297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B66,B97
`Chr2:37671473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:37674451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B108,C12,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796192.1

429 aa

214

429

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 88-371 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 90-291 aa

XP_057796193.1

384 aa

192

384

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 43-326 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 45-246 aa

XP_057796194.1

384 aa

192

384

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 43-326 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 45-246 aa

XP_057796195.1

376 aa

188

376

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 35-318 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 37-238 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796192.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	88	371	1.2e-60	205.9	Protein kinase domain
`XP_057796192.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	90	291	4.3e-24	85.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057796193.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	43	326	8.6e-61	206.3	Protein kinase domain
`XP_057796193.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	45	246	3.3e-24	86.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057796194.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	43	326	8.6e-61	206.3	Protein kinase domain
`XP_057796194.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	45	246	3.3e-24	86.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057796195.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	35	318	8e-61	206.4	Protein kinase domain
`XP_057796195.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	37	238	3.1e-24	86.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940209.1
ATTGGTGATTGTAATTATAGGCGTATTTATTGTAGCAAGTGAAAGAAAAGCGATAAAACATTAAATAGTGGTTAAAAGGTGGAGAGAGAGATCACATGGCGTCGTTGCCGCTGGGACCTGAGCAACATCACCATAATCCACCACCCGACCATCACTATCATCATAATAATGTTATTGACCAAGCTCCTCCTCATCCTCCCGCCGCCGTGAAGCTTTCCGCCGCCCTCAACCGTAATATGGACACCGACAAGGAAATGGCA...

XM_057940211.1
GTAATTATAGGCGTATTTATTGTAGCAAGTGAAAGAAAAGCGATAAAACATTAAATAGTGGTTAAAAGGTGGAGAGAGAGATCACATGGCGTCGTTGCCGCTGGGACCTGAGCAACATCACCATAATCCACCACCCGACCATCACTATCATCATAATAATGTTATTGACCAAGCTCCTCCTCATCCTCCCGCCGCCGTGAAGCTTTCCGCCGCCCTCAACCGTAATATGGACACCGACAAGGTACACCTGCCCCCATTTT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131012288
ATGGCGTCGTTGCCGCTGGGACCTGAGCAACATCACCATAATCCACCACCCGACCATCACTATCATCATAATAATGTTATTGACCAAGCTCCTCCTCATCCTCCCGCCGCCGTGAAGCTTTCCGCCGCCCTCAACCGTAATATGGACACCGACAAGGAAATGGCAGGGCCGCTGGTGGAGGGGAATGATCCACTCACCGGTCACATCATTTCTACTACTATTGGAGGAAAAAATGGCGAGCCCAAACGGACAATTAGTTA...

LOC131012288
ATGAAGTCTTCATTTTGTGAGGAAATGGCAGGGCCGCTGGTGGAGGGGAATGATCCACTCACCGGTCACATCATTTCTACTACTATTGGAGGAAAAAATGGCGAGCCCAAACGGACAATTAGTTACATGGCAGAGCGTGTTGTGGGTACAGGATCTTTTGGAATAGTTTTTCAGGCAAAATGCTTGGAAACTGGAGAAACAGTGGCCATAAAAAAGGTCCTTCAGGATAAGCGGTATAAAAATCGTGAGCTGCAGTTAAT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057796192.1
MASLPLGPEQHHHNPPPDHHYHHNNVIDQAPPHPPAAVKLSAALNRNMDTDKEMAGPLVEGNDPLTGHIISTTIGGKNGEPKRTISYMAERVVGTGSFGIVFQAKCLETGETVAIKKVLQDKRYKNRELQLMRLMDHANVISLKHCFFSTTTRDELFLNLVMDYVPETMYKVLKHYTNSNQRMPLIYVKLYTYQLFRGLGYMHSVAGVSHRDIKPQNILVDPLTHQVKICDFGSAKVLVKGEANISYICSRYYRAPELIF...

XP_057796193.1
MKSSFCEEMAGPLVEGNDPLTGHIISTTIGGKNGEPKRTISYMAERVVGTGSFGIVFQAKCLETGETVAIKKVLQDKRYKNRELQLMRLMDHANVISLKHCFFSTTTRDELFLNLVMDYVPETMYKVLKHYTNSNQRMPLIYVKLYTYQLFRGLGYMHSVAGVSHRDIKPQNILVDPLTHQVKICDFGSAKVLVKGEANISYICSRYYRAPELIFGATEYTSSIDIWSAGCVLAELLLGQPLFPGENAVDQLVEIIKVLG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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