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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002116`

染色体: Chr02 坐标: 37914623-37951736 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002116`
名称	SmilChr02G002116
描述	B3 domain-containing protein At5g25475-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	37914623 - 37951736 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012318`
GeneID	`131012318`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012318`
原始查询	`SmilChr02G002116`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B3 domain-containing protein At5g25475-like
产物	B3 domain-containing protein At5g25475-like
Arabidopsis	`AT5G25475` (AT5G25475) AP2/B3-like transcriptional factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832622] identity=25.3; qcov=0.759; evalue=7.14e-10; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012318

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796242.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796242.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796242.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796242.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796242.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:37914685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,C48,C5
`Chr2:37914709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:37922928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B83,C8
`Chr2:37922975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:37922997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B32,B37,C63
`Chr2:37923005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B140,B83,C8
`Chr2:37923005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B83,C8
`Chr2:37923024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:37923084`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B104,B30,B83,C37,D10,D4
`Chr2:37923111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:37923170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B32,B37,B6,C63
`Chr2:37923176`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A3,A5,B114,B115,B121,B126,B31,B35,B70,B94,C38,C4,C45,C47,C48,C49,C5,C80,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796242.1

330 aa

165

330

PF02362 B3 18-85 aa

XP_057796243.1

323 aa

162

323

PF02362 B3 18-85 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796242.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	18	85	1.5e-17	64.0	B3 DNA binding domain
`XP_057796243.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	18	85	7.2e-18	65.1	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940260.1
ATTTAAGAGTACTTTTGGCGTTGCTATAATTTGGTAAAGTGGTTGATTGTAGATGGCGGCGCGTGGGGGTGCACGAAACGTTTTCAGACGTCAATTACCAAATAGAGTTCCCTCCATCTTTGTGGAGTCTATTGAAGGAAGTGAGCCGCAAGATTTGGCCCTGCGCGACTGCAGTAACAATTTGTGGCACCTCAAGATAGAAAAATTTCACGATGGTTGGTATTTTACAGATGGTTGGGTGAAATTTGTAGAAGATAACA...

XM_057940259.1
ATTTAAGAGTACTTTTGGCGTTGCTATAATTTGGTAAAGTGGTTGATTGTAGATGGCGGCGCGTGGGGGTGCACGAAACGTTTTCAGACGTCAATTACCAAATAGAGTTCCCTCCATCTTTGTGGAGTCTATTGAAGGAAGTGAGCCGCAAGATTTGGCCCTGCGCGACTGCAGTAACAATTTGTGGCACCTCAAGATAGAAAAATTTCACGATGGTTGGTATTTTACAGATGGTTGGGTGAAATTTGTAGAAGATAACA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012318
ATGGCGGCGCGTGGGGGTGCACGAAACGTTTTCAGACGTCAATTACCAAATAGAGTTCCCTCCATCTTTGTGGAGTCTATTGAAGGAAGTGAGCCGCAAGATTTGGCCCTGCGCGACTGCAGTAACAATTTGTGGCACCTCAAGATAGAAAAATTTCACGATGGTTGGTATTTTACAGATGGTTGGGTGAAATTTGTAGAAGATAACATGATTGAAAGGGGCGACGTGTTATTCTACCAATCCTCTTGTAAAGGTGTACT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796242.1
MAARGGARNVFRRQLPNRVPSIFVESIEGSEPQDLALRDCSNNLWHLKIEKFHDGWYFTDGWVKFVEDNMIERGDVLFYQSSCKGVLDFKVLSPSRCEDDEVECLEEVRTTKPQDVKTEVKIEAADDIDNIPSIKWEVGEPAGGSVLGKRKKKQDFYGAEIFKSGRARPPTNPYFVADVREKRVNEMYIPADVVKSYKLQLPETMLLVDSVGRKFETKRTSWKDGRVNYHGGWKALCRSNLAGIGDKLICEFVQGGGGSR...

XP_057796243.1
MAARGGARNVFRRQLPNRVPSIFVESIEGSEPQDLALRDCSNNLWHLKIEKFHDGWYFTDGWVKFVEDNMIERGDVLFYQSSCKGVLDFKVLSPSRCEDDEVECLEEVRTTKPQDVKTEVKIEAADDIDNIPSIKWEVGEPAGGSVLGKRKKKQDFYGAEIFKSGRARPPTNPYFVADVREKRVNEMYIPADVVKSYKLQLPETMLLVDSVGRKFETKRTSWKDGRVNYHGGWKALCRSNLAGIGDKLICEFVQGGGGSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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