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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002122`

染色体: Chr02 坐标: 37997527-38000094 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002122`
名称	SmilChr02G002122
描述	uncharacterized SmilChr02G002122
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	37997527 - 38000094 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012316`
GeneID	`131012316`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012316`
原始查询	`SmilChr02G002122`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0181600; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os10g0181600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G69520` (AT1G69520) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843285] identity=28.4; qcov=0.341; evalue=4.25e-06; confidence=low
Rice	`Os10g0181600` - identity=71.7; qcov=0.93; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01209 (Ubie_methyltran); PF05175 (MTS); PF08241 (Methyltransf_11); PF08242 (Methyltransf_12); PF13489 (Methyltransf_23); PF13649 (Methyltransf_25); PF13847 (Methyltransf_31)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012316

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057796240.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057796240.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057796240.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057796240.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796240.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:37998778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B65
`Chr2:37999087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,C47,C48,C5
`Chr2:37999540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B59
`Chr2:37999561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796240.1

372 aa

186

372

Ubie_methyltran

MTS

Methyltransf_23

Methyltransf_31

Methyltransf_25

Methyltransf_12

Methyltransf_11

PF01209 Ubie_methyltran 193-311 aa PF05175 MTS 199-310 aa PF13489 Methyltransf_23 201-355 aa PF13847 Methyltransf_31 202-315 aa PF13649 Methyltransf_25 203-302 aa PF08242 Methyltransf_12 204-304 aa PF08241 Methyltransf_11 204-305 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796240.1`	Pfam	`PF01209`	Ubie_methyltran	Family	193	311	5.4e-12	46.3	ubiE/COQ5 methyltransferase family
`XP_057796240.1`	Pfam	`PF05175`	MTS	Domain	199	310	1.7e-07	31.7	Methyltransferase small domain
`XP_057796240.1`	Pfam	`PF13489`	Methyltransf_23	Domain	201	355	5.7e-08	33.4	Methyltransferase domain
`XP_057796240.1`	Pfam	`PF13847`	Methyltransf_31	Domain	202	315	2.9e-10	40.8	Methyltransferase domain
`XP_057796240.1`	Pfam	`PF13649`	Methyltransf_25	Domain	203	302	9.7e-21	75.0	Methyltransferase domain
`XP_057796240.1`	Pfam	`PF08242`	Methyltransf_12	Domain	204	304	6.1e-15	56.4	Methyltransferase domain
`XP_057796240.1`	Pfam	`PF08241`	Methyltransf_11	Domain	204	305	1e-19	71.7	Methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940257.1
AAATTGAGATTGAATCATATTCTACCCACGTGTCGCCAAATCATTGGCTATTGGAATTCGCACGCAGATGACATCCCTCTCTATCTTCGAACGTCTTTCCCAACCGCCGTAACGCCCATAAGCCTCTCCGCCGCCAACCAACTCCAAAACCACCATTGCTCCGCCGCGTTCAATCTTCAAAGAATGGCCTTCAGCACAACCTCAAAGCTCAATAGTGGGAATACTTGGGCCACCGGATCCATCCACCACGATTCTCGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012316
ATGGCCTTCAGCACAACCTCAAAGCTCAATAGTGGGAATACTTGGGCCACCGGATCCATCCACCACGATTCTCGCACTCATAGAGGAAGTGCGCCGCCAAGAATCCGAATTGCTGCGGCGGCGCAGTCGAGTGGCGGCAGAGTGACGGCGGATTTCGAGGAGGGGCAGCTGGAGAGACCCAAATGGACCGGCGAGACGCCGCTTTCGCGGCTCGTCGGAGCTCTGATTTCATTCAAACCCCTCTATTCTGTAATGAAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796240.1
MAFSTTSKLNSGNTWATGSIHHDSRTHRGSAPPRIRIAAAAQSSGGRVTADFEEGQLERPKWTGETPLSRLVGALISFKPLYSVMKLGARQVLISTAEKTSIPWRDMTKEILESDVYKEKDSIEDTSLVYPDYYLNPFHAYDEGNLSWLAAAEAEAATMSMVRRAIPHASSLEEANQIVRGNWLQAIENHHLKHSGGTRIGEILDIGCSVGVSTRFLAERFASAKVTGLDLSPYFLAVAQHNEKKRNAGENRMRWIHGNG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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