当前解析结果
SmilChr02G002131| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002131 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002131 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002131 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 38153199 - 38200690 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008412 |
|---|---|
| GeneID | 131008412 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008412 |
| 原始查询 | SmilChr02G002131 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008412 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057791276.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057791276.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791276.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791276.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791276.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:38153234 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A22,B37,B6,C63 |
Chr2:38153252 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B80,C61 |
Chr2:38153256 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B40,B80,C53,C61 |
Chr2:38153273 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B109,C32,C68,C76,D1 |
Chr2:38153281 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B81 |
Chr2:38153282 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B80 |
Chr2:38153283 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B37,C10 |
Chr2:38153288 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B35,C47,C48 |
Chr2:38153301 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,A25,B28,C18,C74 |
Chr2:38153303 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B81,C85 |
Chr2:38153309 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B15,B56,B96 |
Chr2:38155042 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B37 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。