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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002139`

染色体: Chr02 坐标: 38532278-38533094 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002139`
名称	SmilChr02G002139
描述	uncharacterized SmilChr02G002139
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	38532278 - 38533094 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012329`
GeneID	`131012329`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012329`
原始查询	`SmilChr02G002139`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012329

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796252.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057796252.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057796252.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796252.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796252.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:38532511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C80
`Chr2:38532538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C52
`Chr2:38532561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr2:38532564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B104,B106,B125,B19,B28,B37,B73,B79,B9,B94,C57
`Chr2:38532569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	B100,B30,B62,B63,B64,C11,C14,C16,C17,C23,C67,C69,C87,C9,D6
`Chr2:38532577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B88
`Chr2:38532591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B41
`Chr2:38532604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B20,B30,C56
`Chr2:38532611`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A20,B100,B125,B87,C21,C33,C41
`Chr2:38532619`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	54	A10,A14,A15,A19,A7,B102,B105,B114,B115,B117,B123,B127,B132,B133,B137,B138,B26,B28,B32,B36,B50,B54,B64,B65,B66,B68,B72,B73,B76,B78,B79,B81,B88,B89,C1,C15,C17,C23,C26,C27,C30,C34,C36,C39,C49,C5,C53,C61,C70,C82,C86,C87,C9,D4
`Chr2:38532742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B140
`Chr2:38532742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796252.1

127 aa

127

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 77-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796252.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	77	121	2.8e-05	24.8	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940269.1
TAGACCTCTGGATTTTGAAGCTAAATCGAAGGATCATGGTCAACCAGGAATATATAGTGCATCGGGGTCGGACTCAACTCCAGCCGGGTATTAGTCGAGTTAGAACTCCAGTGGCTGCAACCGTTTTATATGATACCCTATACAGAGAGTATGGTATGCTGCATCCAGAGGATCCCCACGGGAATAATCCACCAGAGCGAAATGCATACACACATTGGAATGTGCCCTACAATCTCATCACAATGTTCCAGGGCACTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012329
ATGGTCAACCAGGAATATATAGTGCATCGGGGTCGGACTCAACTCCAGCCGGGTATTAGTCGAGTTAGAACTCCAGTGGCTGCAACCGTTTTATATGATACCCTATACAGAGAGTATGGTATGCTGCATCCAGAGGATCCCCACGGGAATAATCCACCAGAGCGAAATGCATACACACATTGGAATGTGCCCTACAATCTCATCACAATGTTCCAGGGCACTGATGCAGATCATACGTGGCATTGGTTGGAGGCTAATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796252.1
MVNQEYIVHRGRTQLQPGISRVRTPVAATVLYDTLYREYGMLHPEDPHGNNPPERNAYTHWNVPYNLITMFQGTDADHTWHWLEANEILTICNVNASHWCTVVISIERWEVRVYDSLSHVEGATQRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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