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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002142`

染色体: Chr02 坐标: 38543340-38546017 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002142`
名称	SmilChr02G002142
描述	uncharacterized SmilChr02G002142
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	38543340 - 38546017 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012319`
GeneID	`131012319`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012319`
原始查询	`SmilChr02G002142`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012319

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796244.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057796244.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796244.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796244.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796244.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:38544422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B114,B115,B126
`Chr2:38544451`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A20,A23,A25,B18,B37,B43,B87,C37,C57
`Chr2:38544518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C8
`Chr2:38544568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:38544686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr2:38544711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:38544735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr2:38544803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B26
`Chr2:38544803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:38545265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr2:38545291`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	37	A10,A14,A22,A25,A3,B101,B102,B103,B127,B16,B2,B23,B27,B3,B31,B43,B51,B53,B71,B72,B8,B89,B95,B99,C17,C24,C33,C37,C43,C44,C46,C47,C59,C61,C70,C75,C79
`Chr2:38545384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796244.1

323 aa

162

323

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 150-261 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796244.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	150	261	1.4e-06	29.1	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940261.1
CTTGTGAATTTTTTTACTTATTTAATAGGTTAAGAATAACAAAGGCAATGAGCCTTTAACTTATATTAGTGCATACGGAGTTAGAATCAGGGGAAAGCCGGCAGCAAGTATAGGATCCCCTTTGGGTGATGTTGGAAAGGGGAAAGAAGCAAGCTCTGGTAAGAACGTGGGAGTGCCGAAAGATGATCAGACGGCTAGAGGGACTGATGCAGTGGTACTTCAAAAGAAGACAAGTTCAGGTGGTGATCGTTTGCCACTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012319
ATGACTGGAACAGCACGTAATACCATCACTTCAAAGAGGACAATGTTGGCGAAAGGAGCAAAATTTCGATCACCATTTTGTCAAAGGGAAATTTCAACAACGAAGAATCTAACCAAATGTGAGAAGGAGTTGGGTATATACGCTATGTACAAAGACACGCGTGATTGGAAGGAGGTATTGTTCGGATTCAAAGATACAGAGGTTAATCGTTTTAACATGCTATCAATGAGGACGGGTTCCCCAATAGCGAATGATATTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796244.1
MTGTARNTITSKRTMLAKGAKFRSPFCQREISTTKNLTKCEKELGIYAMYKDTRDWKEVLFGFKDTEVNRFNMLSMRTGSPIANDIVNAWAIILNDRENFRSDLSPLRFFASTNLYMDCIEANGISYDNQRSTFFILMTMEIQEYHQNKINLIDMYFFPVYRKGLYYAVCVDLRKGRVFVLDSALDITANEENDIYEEVCNTFKKLLSDLLKYNNEEQKAKIVMNSKMHVVKMKWADPHNTIDTGLYLMRHLEMFMGDAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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